{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.0005991687325333781],
[427.496212515516, 1087.89527899194, 1, 0, 0.2821028195758565, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821028195758566, 0.0005990145594322789],
[427.6752705349885, 1087.716220972468, 1, 0, 0.2822209791540751, 0.002338222639688935, 0, -0.047592306260629, 1, 0.2822209791540751, 0.0005993549684957183],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 0, 0.2821915539070337, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000110801465753971],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821915539070337, 0.002338466455557475, 0, -0.04759726890160672, 1, 0.2821915539070337, 0.0004882211647452427],
[427.496212515516, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821278540022879, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821278540022879, 0.0005991340281421212],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.0005992864801052537],
[427.7453981955885, 1087.828925251687, 0, 1, 0.2822332046525128, 0, 0.000919262189841692, 0.01871071083230232, 0.7177667953474872, 1, 0.0005991069739127109],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.0005993408660325048],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821915539070337, 0.002338466455557475, 0, -0.04759726890160672, 1, 0.2821915539070337, 0.0005993174008148509],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821915539070337, 0.002338466455557475, 0, -0.04759726890160672, 1, 0.2821915539070337, 0.0005991882220772175],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.0005990743623768563],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821915539070337, 0.002338466455557475, 0, -0.04759726890160672, 1, 0.2821915539070337, 0.0005991371981857221],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821915539070337, 0.002338466455557475, 0, -0.04759726890160672, 1, 0.2821915539070337, 0.0005990164683889722],
[427.798835942604, 1087.592655564852, 0, 1, 0.2823025194083975, 0, 0.0009194618912543503, 0.01871477556533099, 0.7176974805916025, 1, 0.000599201698603715],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.000599134045320839],
[427.2579286782986, 1087.96540665254, 1, 0, 0.2819768668524432, 0.002340506595380104, 0, -0.04763879401457286, 1, 0.2819768668524432, 0.0005992914423712007],
[428.0231665864175, 1087.368324921038, 0, 1, 0.2824505541869156, 0, 0.000919651581788183, 0.01871863653640691, 0.7175494458130844, 1, 0.0005992432140189313],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.0005992715276490329],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821915539070337, 0.002338466455557475, 0, -0.04759726890160672, 1, 0.2821915539070337, 0.0005991617869609217],
[427.6306797659865, 1087.491897878579, 1, 0, 0.2822416391093507, 0.002338466455557475, 0, -0.04759726890160672, 1, 0.2822416391093507, 0.0005992001055736525],
[427.496212515516, 1087.89527899194, 1, 0, 0.2821028195758565, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821028195758566, 0.0005991443453564079],
[427.765147016457, 1087.626344490999, 1, 0, 0.2822802882382109, 0.0023377313625823, 0, -0.04758230678063043, 1, 0.2822802882382109, 0.000599205138759646],
[427.496212515516, 1087.89527899194, 1, 0, 0.2821028195758565, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821028195758566, 0.0005991710047194683],
[427.496212515516, 1087.89527899194, 1, 0, 0.2821028195758565, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821028195758566, 0.0005992879114511435],
[427.7453981955885, 1087.828925251687, 0, 1, 0.2822332046525128, 0, 0.000919262189841692, 0.01871071083230232, 0.7177667953474872, 1, 0.0005990926885158005],
[427.462523589369, 1087.928967918087, 0, 1, 0.28208058840567, 0, 0.000919177657263459, 0.01870899025177078, 0.71791941159433, 1, 0.0005992909649016868],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.0005991539224702076],
[427.4063360340476, 1087.985155473408, 1, 0, 0.2820435104917208, 0.002339693906457061, 0, -0.04762225250160333, 1, 0.2820435104917207, 0.000599183907723975],
[427.496212515516, 1087.89527899194, 1, 0, 0.2821028195758565, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821028195758566, 0.0005990546149715134],
[427.4625235893691, 1087.928967918087, 0, 1, 0.28208058840567, 0, 0.000919177657263459, 0.01870899025177078, 0.7179194115943299, 1, 0.0005991781438637285],
[427.1643686921335, 1088.227122815322, 1, 0, 0.2818838373357937, 0.002341019226537411, 0, -0.04764922813603897, 1, 0.2818838373357937, 0.0005990521957860872],
[427.496212515516, 1087.89527899194, 1, 0, 0.2821028195758565, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821028195758566, 0.0005992843111877074],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.0005990352852081435],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.0005989829658171716],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.0005991958053749811],
[427.496212515516, 1087.860481617049, 1, 0, 0.2821092975474183, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821092975474183, 0.0005991340469494512],
[427.496212515516, 1087.89527899194, 1, 0, 0.2821028195758565, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821028195758566, 0.00059921284378878],
[427.5231665864175, 1087.868324921038, 0, 1, 0.2821206064454889, 0, 0.0009192288966337757, 0.01871003318060199, 0.7178793935545111, 1, 0.0005991783310040577],
[427.4625235893691, 1087.868324921038, 0, 1, 0.2820918771696432, 0, 0.0009192288966337757, 0.01871003318060199, 0.7179081228303568, 1, 0.0005992739767447535],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821915539070337, 0.002338466455557475, 0, -0.04759726890160672, 1, 0.2821915539070337, 0.0005992736690689378],
[427.6306797659865, 1087.592655564852, 0, 1, 0.2822228709094005, 0, 0.0009194618912543503, 0.01871477556533099, 0.7177771290905994, 1, 0.0005990482983669465],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821915539070337, 0.002338466455557475, 0, -0.04759726890160672, 1, 0.2821915539070337, 0.0005990484812294091],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821915539070337, 0.002338466455557475, 0, -0.04759726890160672, 1, 0.2821915539070337, 0.000599048298302129],
[427.765147016457, 1087.626344490999, 1, 0, 0.2822802882382109, 0.0023377313625823, 0, -0.04758230678063043, 1, 0.2822802882382109, 0.0005991530659728897],
[427.765147016457, 1087.626344490999, 1, 0, 0.2822802882382109, 0.0023377313625823, 0, -0.04758230678063043, 1, 0.2822802882382109, 0.0005989737520063831],
[427.4625235893691, 1087.928967918087, 0, 1, 0.28208058840567, 0, 0.000919177657263459, 0.01870899025177078, 0.7179194115943299, 1, 0.0005990484812294091],
[427.765147016457, 1087.626344490999, 1, 0, 0.2822802882382109, 0.0023377313625823, 0, -0.04758230678063043, 1, 0.2822802882382109, 0.0005991530670736786],
[427.496212515516, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821278540022879, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821278540022879, 0.0005990482983591999],
[427.5969908398395, 1087.794500667617, 0, 1, 0.2821693227368471, 0, 0.0009192912810151787, 0.01871130295557346, 0.7178306772631529, 1, 0.0005992358793774798],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.0005990484812294091],
[427.6228364619974, 1087.768655045459, 0, 1, 0.2821863781461607, 0, 0.0009193131235779259, 0.01871174754024138, 0.7178136218538393, 1, 0.0005990835550542482],
[427.368963603204, 1088.022527904252, 0, 1, 0.2820188485934238, 0, 0.0009190986163918856, 0.01870738144972465, 0.7179811514065761, 1, 0.0005992791309705189],
[427.798835942604, 1087.592655564852, 0, 1, 0.2823025194083975, 0, 0.0009194618912543503, 0.01871477556533099, 0.7176974805916025, 1, 0.0005989458963259271],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821915539070337, 0.002338466455557475, 0, -0.04759726890160672, 1, 0.2821915539070337, 0.0005990485810561118],
[428.0231665864176, 1087.368324921038, 0, 1, 0.2824505541869156, 0, 0.000919651581788183, 0.01871863653640691, 0.7175494458130844, 1, 0.0005989272459258657],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.0005992450869593364],
[427.496212515516, 1087.89527899194, 1, 0, 0.2821028195758565, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821028195758566, 0.0005991225278710572],
[427.3617452650456, 1088.02974624241, 0, 0, 0.2820140852446795, 0, 0, 0, 1, 1, 2.228480639827572e-05],
[427.496212515516, 1087.89527899194, 1, 0, 0.2821028195758565, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821028195758566, 0.0005767175840948737],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.0005992561484665624],
[427.2579286782986, 1087.96540665254, 1, 0, 0.2819768668524432, 0.002340506595380104, 0, -0.04763879401457286, 1, 0.2819768668524432, 0.00059926049692657],
[427.5969908398395, 1087.768655045459, 0, 1, 0.2821741353322229, 0, 0.0009193131235779259, 0.01871174754024138, 0.7178258646677771, 1, 0.0005992615733450559],
[427.6385230699756, 1087.75296843748, 0, 1, 0.2821967296679068, 0, 0.0009193263810959446, 0.01871201738445856, 0.7178032703320932, 1, 0.0005991413349177217],
[427.6306797659865, 1087.727122815322, 0, 1, 0.2821978274949631, 0, 0.0009193482253267146, 0.0187124620030775, 0.717802172505037, 1, 0.0005992661486304477],
[427.496212515516, 1087.89527899194, 1, 0, 0.2821028195758565, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821028195758566, 0.0005992675321791076],
[427.5969908398395, 1087.794500667617, 0, 1, 0.2821693227368471, 0, 0.0009192912810151787, 0.01871130295557346, 0.7178306772631529, 1, 0.0005992722907318518],
[427.368963603204, 1088.022527904252, 0, 1, 0.2820188485934238, 0, 0.0009190986163918856, 0.01870738144972465, 0.7179811514065761, 1, 0.0005990352904153197],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821915539070337, 0.002338466455557475, 0, -0.04759726890160672, 1, 0.2821915539070337, 0.0005990352538767734],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821915539070337, 0.002338466455557475, 0, -0.04759726890160672, 1, 0.2821915539070337, 0.0005992275097548182],
[427.496212515516, 1087.860481617049, 1, 0, 0.2821092975474183, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821092975474183, 0.0005990353082282646],
[427.496212515516, 1087.89527899194, 1, 0, 0.2821028195758565, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821028195758566, 0.0005991225295228399],
[427.798835942604, 1087.592655564852, 0, 1, 0.2823025194083975, 0, 0.0009194618912543503, 0.01871477556533099, 0.7176974805916025, 1, 0.0005990055504956217],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.00059913517506858],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.0005990313956366004],
[427.368963603204, 1088.022527904252, 0, 1, 0.2820188485934238, 0, 0.0009190986163918856, 0.01870738144972465, 0.7179811514065761, 1, 0.0005991820458190034],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821915539070337, 0.002338466455557475, 0, -0.04759726890160672, 1, 0.2821915539070337, 0.0005993090689854243],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821915539070337, 0.002338466455557475, 0, -0.04759726890160672, 1, 0.2821915539070337, 0.00059930758536981],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.000599122881330783],
[428.0231665864175, 1087.368324921038, 0, 1, 0.2824505541869156, 0, 0.000919651581788183, 0.01871863653640691, 0.7175494458130844, 1, 0.0005992348258472123],
[427.6306797659865, 1087.727122815322, 0, 1, 0.2821978274949631, 0, 0.0009193482253267146, 0.0187124620030775, 0.717802172505037, 1, 0.0005993192474135796],
[427.496212515516, 1087.89527899194, 1, 0, 0.2821028195758565, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821028195758566, 0.0005990641432925748],
[427.5414982279826, 1088.065019638612, 0, 0, 0.2820926758944008, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002554034072572799],
[427.5860889969846, 1087.912915690041, 1, 0, 0.2821421113933941, 0.002338710322278638, 0, -0.0476022325776414, 1, 0.2821421113933942, 0.0003435876253043445],
[427.765147016457, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2822552425080457, 0.0023377313625823, 0, -0.04758230678063043, 1, 0.2822552425080457, 0.0005988677724759805]
],
"NAMES": [
["Node1"],
["Node1007"],
["Node624"],
["Node650"],
["Node649"],
["Node646"],
["Node636"],
["Node643"],
["Node502"],
["Node473"],
["Node489"],
["Node495"],
["Node498"],
["Node565"],
["Node554"],
["Node532"],
["Node512"],
["Node529"],
["Node536"],
["Node541"],
["Node544"],
["Node548"],
["Node551"],
["Node575"],
["Node580"],
["Node584"],
["Node594"],
["Node590"],
["Node601"],
["Node599"],
["Node661"],
["Node666"],
["Node685"],
["Node71"],
["Node707"],
["Node727"],
["Node751"],
["Node747"],
["Node85"],
["Node81"],
["Node856"],
["Node452"],
["Node449"],
["Node446"],
["Node443"],
["Node437"],
["Node431"],
["Node428"],
["Node112"],
["Node106"],
["Node425"],
["Node422"],
["Node417"],
["Node414"],
["Node173"],
["Node328"],
["Node323"],
["Node318"],
["Node314"],
["Node313"],
["Node303"],
["Node300"],
["Node293"],
["Node288"],
["Node285"],
["Node282"],
["Node278"],
["Node275"],
["Node272"],
["Node269"],
["Node266"],
["Node263"],
["Node260"],
["Node257"],
["Node254"],
["Node248"],
["Node245"],
["Node206"],
["Node251"],
["Node309"],
["Node336"],
["Node342"],
["Node353"],
["Node352"],
["Node365"]
],
"RESOLVED": [
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.0005991687325333781],
[427.496212515516, 1087.89527899194, 1, 0, 0.2821028195758565, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821028195758566, 0.0005990145594322789],
[427.6752705349885, 1087.716220972468, 1, 0, 0.2822209791540751, 0.002338222639688935, 0, -0.047592306260629, 1, 0.2822209791540751, 0.0005993549684957183],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 0, 0.2821915539070337, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000110801465753971],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821915539070337, 0.002338466455557475, 0, -0.04759726890160672, 1, 0.2821915539070337, 0.0004882211647452427],
[427.496212515516, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821278540022879, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821278540022879, 0.0005991340281421212],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.0005992864801052537],
[427.7453981955885, 1087.828925251687, 0, 1, 0.2822332046525128, 0, 0.000919262189841692, 0.01871071083230232, 0.7177667953474872, 1, 0.0005991069739127109],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.0005993408660325048],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821915539070337, 0.002338466455557475, 0, -0.04759726890160672, 1, 0.2821915539070337, 0.0005993174008148509],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821915539070337, 0.002338466455557475, 0, -0.04759726890160672, 1, 0.2821915539070337, 0.0005991882220772175],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.0005990743623768563],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821915539070337, 0.002338466455557475, 0, -0.04759726890160672, 1, 0.2821915539070337, 0.0005991371981857221],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821915539070337, 0.002338466455557475, 0, -0.04759726890160672, 1, 0.2821915539070337, 0.0005990164683889722],
[427.798835942604, 1087.592655564852, 0, 1, 0.2823025194083975, 0, 0.0009194618912543503, 0.01871477556533099, 0.7176974805916025, 1, 0.000599201698603715],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.000599134045320839],
[427.2579286782986, 1087.96540665254, 1, 0, 0.2819768668524432, 0.002340506595380104, 0, -0.04763879401457286, 1, 0.2819768668524432, 0.0005992914423712007],
[428.0231665864175, 1087.368324921038, 0, 1, 0.2824505541869156, 0, 0.000919651581788183, 0.01871863653640691, 0.7175494458130844, 1, 0.0005992432140189313],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.0005992715276490329],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821915539070337, 0.002338466455557475, 0, -0.04759726890160672, 1, 0.2821915539070337, 0.0005991617869609217],
[427.6306797659865, 1087.491897878579, 1, 0, 0.2822416391093507, 0.002338466455557475, 0, -0.04759726890160672, 1, 0.2822416391093507, 0.0005992001055736525],
[427.496212515516, 1087.89527899194, 1, 0, 0.2821028195758565, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821028195758566, 0.0005991443453564079],
[427.765147016457, 1087.626344490999, 1, 0, 0.2822802882382109, 0.0023377313625823, 0, -0.04758230678063043, 1, 0.2822802882382109, 0.000599205138759646],
[427.496212515516, 1087.89527899194, 1, 0, 0.2821028195758565, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821028195758566, 0.0005991710047194683],
[427.496212515516, 1087.89527899194, 1, 0, 0.2821028195758565, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821028195758566, 0.0005992879114511435],
[427.7453981955885, 1087.828925251687, 0, 1, 0.2822332046525128, 0, 0.000919262189841692, 0.01871071083230232, 0.7177667953474872, 1, 0.0005990926885158005],
[427.462523589369, 1087.928967918087, 0, 1, 0.28208058840567, 0, 0.000919177657263459, 0.01870899025177078, 0.71791941159433, 1, 0.0005992909649016868],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.0005991539224702076],
[427.4063360340476, 1087.985155473408, 1, 0, 0.2820435104917208, 0.002339693906457061, 0, -0.04762225250160333, 1, 0.2820435104917207, 0.000599183907723975],
[427.496212515516, 1087.89527899194, 1, 0, 0.2821028195758565, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821028195758566, 0.0005990546149715134],
[427.4625235893691, 1087.928967918087, 0, 1, 0.28208058840567, 0, 0.000919177657263459, 0.01870899025177078, 0.7179194115943299, 1, 0.0005991781438637285],
[427.1643686921335, 1088.227122815322, 1, 0, 0.2818838373357937, 0.002341019226537411, 0, -0.04764922813603897, 1, 0.2818838373357937, 0.0005990521957860872],
[427.496212515516, 1087.89527899194, 1, 0, 0.2821028195758565, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821028195758566, 0.0005992843111877074],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.0005990352852081435],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.0005989829658171716],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.0005991958053749811],
[427.496212515516, 1087.860481617049, 1, 0, 0.2821092975474183, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821092975474183, 0.0005991340469494512],
[427.496212515516, 1087.89527899194, 1, 0, 0.2821028195758565, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821028195758566, 0.00059921284378878],
[427.5231665864175, 1087.868324921038, 0, 1, 0.2821206064454889, 0, 0.0009192288966337757, 0.01871003318060199, 0.7178793935545111, 1, 0.0005991783310040577],
[427.4625235893691, 1087.868324921038, 0, 1, 0.2820918771696432, 0, 0.0009192288966337757, 0.01871003318060199, 0.7179081228303568, 1, 0.0005992739767447535],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821915539070337, 0.002338466455557475, 0, -0.04759726890160672, 1, 0.2821915539070337, 0.0005992736690689378],
[427.6306797659865, 1087.592655564852, 0, 1, 0.2822228709094005, 0, 0.0009194618912543503, 0.01871477556533099, 0.7177771290905994, 1, 0.0005990482983669465],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821915539070337, 0.002338466455557475, 0, -0.04759726890160672, 1, 0.2821915539070337, 0.0005990484812294091],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821915539070337, 0.002338466455557475, 0, -0.04759726890160672, 1, 0.2821915539070337, 0.000599048298302129],
[427.765147016457, 1087.626344490999, 1, 0, 0.2822802882382109, 0.0023377313625823, 0, -0.04758230678063043, 1, 0.2822802882382109, 0.0005991530659728897],
[427.765147016457, 1087.626344490999, 1, 0, 0.2822802882382109, 0.0023377313625823, 0, -0.04758230678063043, 1, 0.2822802882382109, 0.0005989737520063831],
[427.4625235893691, 1087.928967918087, 0, 1, 0.28208058840567, 0, 0.000919177657263459, 0.01870899025177078, 0.7179194115943299, 1, 0.0005990484812294091],
[427.765147016457, 1087.626344490999, 1, 0, 0.2822802882382109, 0.0023377313625823, 0, -0.04758230678063043, 1, 0.2822802882382109, 0.0005991530670736786],
[427.496212515516, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821278540022879, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821278540022879, 0.0005990482983591999],
[427.5969908398395, 1087.794500667617, 0, 1, 0.2821693227368471, 0, 0.0009192912810151787, 0.01871130295557346, 0.7178306772631529, 1, 0.0005992358793774798],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.0005990484812294091],
[427.6228364619974, 1087.768655045459, 0, 1, 0.2821863781461607, 0, 0.0009193131235779259, 0.01871174754024138, 0.7178136218538393, 1, 0.0005990835550542482],
[427.368963603204, 1088.022527904252, 0, 1, 0.2820188485934238, 0, 0.0009190986163918856, 0.01870738144972465, 0.7179811514065761, 1, 0.0005992791309705189],
[427.798835942604, 1087.592655564852, 0, 1, 0.2823025194083975, 0, 0.0009194618912543503, 0.01871477556533099, 0.7176974805916025, 1, 0.0005989458963259271],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821915539070337, 0.002338466455557475, 0, -0.04759726890160672, 1, 0.2821915539070337, 0.0005990485810561118],
[428.0231665864176, 1087.368324921038, 0, 1, 0.2824505541869156, 0, 0.000919651581788183, 0.01871863653640691, 0.7175494458130844, 1, 0.0005989272459258657],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.0005992450869593364],
[427.496212515516, 1087.89527899194, 1, 0, 0.2821028195758565, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821028195758566, 0.0005991225278710572],
[427.3617452650456, 1088.02974624241, 0, 0, 0.2820140852446795, 0, 0, 0, 1, 1, 2.228480639827572e-05],
[427.496212515516, 1087.89527899194, 1, 0, 0.2821028195758565, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821028195758566, 0.0005767175840948737],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.0005992561484665624],
[427.2579286782986, 1087.96540665254, 1, 0, 0.2819768668524432, 0.002340506595380104, 0, -0.04763879401457286, 1, 0.2819768668524432, 0.00059926049692657],
[427.5969908398395, 1087.768655045459, 0, 1, 0.2821741353322229, 0, 0.0009193131235779259, 0.01871174754024138, 0.7178258646677771, 1, 0.0005992615733450559],
[427.6385230699756, 1087.75296843748, 0, 1, 0.2821967296679068, 0, 0.0009193263810959446, 0.01871201738445856, 0.7178032703320932, 1, 0.0005991413349177217],
[427.6306797659865, 1087.727122815322, 0, 1, 0.2821978274949631, 0, 0.0009193482253267146, 0.0187124620030775, 0.717802172505037, 1, 0.0005992661486304477],
[427.496212515516, 1087.89527899194, 1, 0, 0.2821028195758565, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821028195758566, 0.0005992675321791076],
[427.5969908398395, 1087.794500667617, 0, 1, 0.2821693227368471, 0, 0.0009192912810151787, 0.01871130295557346, 0.7178306772631529, 1, 0.0005992722907318518],
[427.368963603204, 1088.022527904252, 0, 1, 0.2820188485934238, 0, 0.0009190986163918856, 0.01870738144972465, 0.7179811514065761, 1, 0.0005990352904153197],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821915539070337, 0.002338466455557475, 0, -0.04759726890160672, 1, 0.2821915539070337, 0.0005990352538767734],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821915539070337, 0.002338466455557475, 0, -0.04759726890160672, 1, 0.2821915539070337, 0.0005992275097548182],
[427.496212515516, 1087.860481617049, 1, 0, 0.2821092975474183, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821092975474183, 0.0005990353082282646],
[427.496212515516, 1087.89527899194, 1, 0, 0.2821028195758565, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821028195758566, 0.0005991225295228399],
[427.798835942604, 1087.592655564852, 0, 1, 0.2823025194083975, 0, 0.0009194618912543503, 0.01871477556533099, 0.7176974805916025, 1, 0.0005990055504956217],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.00059913517506858],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.0005990313956366004],
[427.368963603204, 1088.022527904252, 0, 1, 0.2820188485934238, 0, 0.0009190986163918856, 0.01870738144972465, 0.7179811514065761, 1, 0.0005991820458190034],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821915539070337, 0.002338466455557475, 0, -0.04759726890160672, 1, 0.2821915539070337, 0.0005993090689854243],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2821915539070337, 0.002338466455557475, 0, -0.04759726890160672, 1, 0.2821915539070337, 0.00059930758536981],
[427.6306797659865, 1087.76081174147, 0, 1, 0.2821915539070337, 0, 0.0009193197522891385, 0.01871188246137711, 0.7178084460929663, 1, 0.000599122881330783],
[428.0231665864175, 1087.368324921038, 0, 1, 0.2824505541869156, 0, 0.000919651581788183, 0.01871863653640691, 0.7175494458130844, 1, 0.0005992348258472123],
[427.6306797659865, 1087.727122815322, 0, 1, 0.2821978274949631, 0, 0.0009193482253267146, 0.0187124620030775, 0.717802172505037, 1, 0.0005993192474135796],
[427.496212515516, 1087.89527899194, 1, 0, 0.2821028195758565, 0.002339202010973851, 0, -0.0476122404351355, 1, 0.2821028195758566, 0.0005990641432925748],
[427.5414982279826, 1088.065019638612, 0, 0, 0.2820926758944008, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002554034072572799],
[427.5860889969846, 1087.912915690041, 1, 0, 0.2821421113933941, 0.002338710322278638, 0, -0.0476022325776414, 1, 0.2821421113933942, 0.0003435876253043445],
[427.765147016457, 1087.76081174147, 1, 0, 0.2822552425080457, 0.0023377313625823, 0, -0.04758230678063043, 1, 0.2822552425080457, 0.0005988677724759805]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.93873994865356, 0, 0, 0.2125896433186342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.462172274218755, 0, 0, 0.4061454230765794, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -20.35405245539854, 1, 0.3333333333333333, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 2.20008533280008, 0, 0, 0.1648425894497096, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9843133920217289, 2.015686607978273, 0, 0, 0.3281044640072427, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9986888007440505, 2.001311199255948, 0, 1, 0.3328962669146836, 0, 0.4996724149506493, 10.17035854442118, 0.6671037330853165, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.187119972330265, 1.476567674434805, 0, 0, 0.4456678596576327, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 1.633127064732731, 0, 0, 0.2100490662988453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.066966895388268, 0, 1, 0.3109166403488202, 0, 0.4838006850671672, 9.847304521814868, 0.6890833596511798, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6657378388866297, 2.334262161113371, 0, 1, 0.2219126129622098, 0, 0.4284008954345689, 8.719694297614916, 0.7780873870377901, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.930982377220105, 2.069017622779896, 1, 0, 0.3103274590733682, 1.074134188217376, 0, -21.86298361111339, 1, 0.3103274590733682, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.93873994865356, 0, 0, 0.2125896433186342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 10.17702622769927, 0.6666666666666667, 1, 0.04913026544425401],
[1.187119972330265, 1.476567674434805, 0, 0, 0.4456678596576327, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.476567674434805, 2.523432325565196, 0, 0, 0.1588558914782683, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 10.17702622769927, 0.6666666666666667, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -20.35405245539854, 1, 0.3333333333333333, 0.04913026544425401],
[0.476567674434805, 2.523432325565196, 0, 0, 0.1588558914782683, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 2.20008533280008, 0, 0, 0.1648425894497096, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.004787172664515901, 2.995212827335485, 0, 1, 0.0015957242215053, 0, 0.3338660915423467, 6.795527940331813, 0.9984042757784947, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6343361203613463, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2407954381593249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6343361203613463, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2407954381593249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9843133920217289, 2.015686607978273, 0, 0, 0.3281044640072427, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.543945526728802, 0, 0, 0.253186578827081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3180164715169775, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9309821300341614, 2.069017869965839, 1, 0, 0.3103273766780538, 1.074134473411757, 0, -21.86298941597478, 1, 0.3103273766780539, 0.04913026544425401],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9843133920217289, 2.015686607978273, 0, 0, 0.3281044640072427, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -20.35405245539854, 1, 0.3333333333333333, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.93873994865356, 0, 0, 0.2125896433186342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.93873994865356, 0, 0, 0.2125896433186342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.476567674434805, 2.523432325565196, 0, 0, 0.1588558914782683, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6343361203613463, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2407954381593249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 2.131498424877468, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.7849736408619979, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2616578802873326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999043604915482, 2.000095639508451, 0, 1, 0.3333014534971828, 0, 0.499976091266197, 10.1765395880773, 0.6666985465028172, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 2.02792148665749, 0, 0, 0.1763689698354082, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.996720286088885, 2, 0, 0.3336981448158886, 2.000000000000001, 0, -40.70810491079708, 0.9999999999999999, 0.1113544518535659, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6343361203613463, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2407954381593249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.93873994865356, 0, 0, 0.2125896433186342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -20.35405245539854, 1, 0.3333333333333333, 0.04913026544425401],
[0.6653275008308236, 2.334672499169177, 1, 0, 0.2217758336102745, 1.50301918792062, 0, -30.5925313924068, 1, 0.2217758336102745, 0.04913026544425401],
[1.187119972330265, 1.476567674434805, 0, 0, 0.4456678596576327, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.187119972330265, 1.476567674434805, 0, 0, 0.4456678596576327, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 1.633127064732731, 0, 0, 0.2100490662988453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.932622147706004, 1.067377852293997, 0, 0, 0.6442073825686678, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.932622147706004, 1.067377852293997, 0, 0, 0.6442073825686678, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 20.35405245539854, 0.4444444444444445, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 10.17702622769927, 0.6666666666666667, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 1, 0.2212292155883564, 0, 0.4280249593404618, 8.712042474635583, 0.7787707844116436, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6343361203613463, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2407954381593249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 10.17702622769927, 0.6666666666666667, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.462172274218755, 0, 0, 0.4061454230765794, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.543945526728802, 0, 0, 0.253186578827081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -20.35405245539854, 1, 0.3333333333333333, 0.04913026544425401],
[0.476567674434805, 2.523432325565196, 0, 0, 0.1588558914782683, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9309825803873458, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3176349755938541, 1.074133953810327, 0, -21.86297883998001, 1, 0.3176349755938541, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.462172274218755, 0, 0, 0.4061454230765794, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9979488310020711, 2.002051168997928, 0, 1, 0.3326496103340238, 0, 0.4994877331234859, 10.16659952082354, 0.6673503896659763, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 10.17702622769927, 0.6666666666666667, 1, 0.04913026544425401],
[0, 2.131498424877468, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.476567674434805, 2.523432325565196, 0, 0, 0.1588558914782683, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 2.20008533280008, 0, 0, 0.1648425894497096, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.7849736408619979, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2616578802873326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.543945526728802, 0, 0, 0.253186578827081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.187119972330265, 1.476567674434805, 0, 0, 0.4456678596576327, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9309819803545819, 2.069018019645418, 1, 0, 0.3103273267848606, 1.074134646106825, 0, -21.86299293101926, 1, 0.3103273267848605, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9995890752927575, 2.000410924707241, 0, 1, 0.3331963584309193, 0, 0.4998972899262431, 10.17493566147032, 0.6668036415690808, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6343361203613463, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2407954381593249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.187119972330265, 1.476567674434805, 0, 0, 0.4456678596576327, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 2.131498424877468, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.665327010053828, 2.334672989946172, 1, 0, 0.2217756700179426, 1.503020296619395, 0, -30.59255395891983, 1, 0.2217756700179426, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 2.02792148665749, 0, 0, 0.1763689698354082, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.097938434326336, 1.780775571576737, 0, 0, 0.3813989274637599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 2.20008533280008, 0, 0, 0.1648425894497096, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.476567674434805, 2.523432325565196, 0, 0, 0.1588558914782683, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.462172274218755, 0, 0, 0.4061454230765794, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4347947638396093, 2.027377510379147, 1, 0, 0.1765899033111195, 2.299935701086061, 0, -46.81301190394948, 1, 0.1765899033111195, 0.04913026544425401],
[0.9995890826417358, 2.000095667927829, 0, 1, 0.3332313778812721, 0, 0.4999760841620322, 10.17653944347876, 0.6667686221187279, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -20.35405245539854, 1, 0.3333333333333333, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.932622147706004, 1.067377852293997, 0, 0, 0.6442073825686678, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6343361203613463, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2407954381593249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -10.17702622769927, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.04913026544425401],
[0.9968081665258267, 2.003191833474172, 0, 1, 0.3322693888419424, 0, 0.4992033130774509, 10.16081042028717, 0.6677306111580577, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.015686607978273, 0, 0, 0.3163244507238016, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.932622147706004, 0, 0, 0.3409917642415111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 10.17702622769927, 0.6666666666666667, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 2.131498424877468, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.7849736408619979, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2616578802873326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.462172274218755, 0, 0, 0.4061454230765794, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6657385102348428, 2.334261489765158, 0, 1, 0.2219128367449475, 0, 0.4284010186453474, 8.719696805453566, 0.7780871632550524, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.930982345748919, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3176349209674398, 1.074134224527706, 0, -21.86298435017576, 1, 0.3176349209674398, 0.04913026544425401],
[0.9995891002602478, 2.000410899739751, 1, 1, 0.3331963667534161, 1.000411068647753, 0.4998972961655517, -10.18748357975212, 0.8889801811823229, 0.5553729146891553, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -40.70810491079708, 1, 0.1111111111111109, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.7849736408619979, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2616578802873326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.543945526728802, 0, 0, 0.253186578827081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.543945526728802, 0, 0, 0.253186578827081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 2.131498424877468, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9968089482895882, 2.003191051710411, 0, 1, 0.3322696494298628, 0, 0.4992035078961425, 10.16081438563704, 0.6677303505701372, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.932622147706004, 1.067377852293997, 0, 0, 0.6442073825686678, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.543945526728802, 0, 0, 0.253186578827081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.926936351584508, 1.073063648415493, 1, 0, 0.6423121171948358, 0.5189585007193964, 0, -10.56290854581757, 1, 0.6423121171948358, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.543945526728802, 0, 0, 0.253186578827081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9844090407543323, 2.015590959245669, 0, 1, 0.3281363469181106, 0, 0.4961324099083318, 10.09830509609747, 0.6718636530818893, 1, 0.04913026544425401],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5451545823574171, 2.454845417642583, 0, 0, 0.181718194119139, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.928075326414363, 1.069873502953494, 1, 0, 0.6431314996196631, 0.5186519355857832, 0, -10.55666870300701, 1, 0.6431314996196631, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 2.02792148665749, 0, 0, 0.1763689698354082, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9309826159407297, 2.016901862447166, 1, 0, 0.315813805719366, 1.074133912790123, 0, -21.86297800505263, 1, 0.315813805719366, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 2.20008533280008, 0, 0, 0.1648425894497096, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9979488891467502, 2.001311408560287, 0, 1, 0.332731670508789, 0, 0.4996723626931128, 10.17035748076854, 0.667268329491211, 1, 0.04913026544425401],
[0.9979492171500842, 2.002050782849915, 0, 1, 0.3326497390500281, 0, 0.4994878294627983, 10.16660148171895, 0.6673502609499719, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 2.131498424877468, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.7849736408619979, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2616578802873326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.93873994865356, 0, 0, 0.2125896433186342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 10.17702622769927, 0.6666666666666667, 1, 0.04913026544425401],
[0.476567674434805, 2.523432325565196, 0, 0, 0.1588558914782683, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.7849736408619979, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2616578802873326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.93873994865356, 0, 0, 0.2125896433186342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.932622147706004, 1.067377852293997, 0, 0, 0.6442073825686678, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 2.20008533280008, 0, 0, 0.1648425894497096, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.7849736408619979, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2616578802873326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6343361203613463, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2407954381593249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4356496599628513, 2.200915906492109, 0, 1, 0.1652337668008809, 0, 0.4543562964174457, 9.247991890721295, 0.8347662331991191, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.543945526728802, 0, 0, 0.253186578827081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.004784648491054112, 2.995215351508946, 0, 1, 0.001594882830351371, 0, 0.3338658101816333, 6.795522213501094, 0.9984051171696486, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 10.17702622769927, 0.6666666666666667, 1, 0.04913026544425401],
[1.187119972330265, 1.476567674434805, 0, 0, 0.4456678596576327, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.187119972330265, 1.476567674434805, 0, 0, 0.4456678596576327, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9309819344312159, 2.069018065568784, 1, 0, 0.310327311477072, 1.074134699091611, 0, -21.86299400947437, 1, 0.3103273114770719, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9309217135568477, 2.069078286443153, 1, 0, 0.3103072378522825, 1.074204184344588, 0, -21.86440831595834, 1, 0.3103072378522824, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999589079504434, 0, 1, 0.3333789974209437, 0, 0.5001027512351857, 10.17911763173009, 0.6666210025790562, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9309825370205005, 2.0690174629795, 1, 0, 0.3103275123401668, 1.074134003845423, 0, -21.86297985839699, 1, 0.3103275123401668, 0.04913026544425401],
[0.9309823175111835, 2.069017682488817, 1, 0, 0.3103274391703944, 1.074134257107399, 0, -21.86298501330454, 1, 0.3103274391703944, 0.04913026544425401],
[0.7849736408619979, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2616578802873326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.7849736408619979, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2616578802873326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 2.20008533280008, 0, 0, 0.1648425894497096, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.543945526728802, 0, 0, 0.253186578827081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6657376347107108, 2.33426236528929, 0, 1, 0.2219125449035702, 0, 0.4284008579627115, 8.719693534910766, 0.7780874550964297, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.93873994865356, 0, 0, 0.2125896433186342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 2.131498424877468, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4356496933190379, 2.200915926297183, 0, 1, 0.165233776120638, 0, 0.4543562923288934, 9.247991807502686, 0.8347662238793621, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 1.633127064732731, 0, 0, 0.2100490662988453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.476567674434805, 2.523432325565196, 0, 0, 0.1588558914782683, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.93873994865356, 0, 0, 0.2125896433186342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.93873994865356, 0, 0, 0.2125896433186342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.187119972330265, 1.476567674434805, 0, 0, 0.4456678596576327, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9309819245774625, 2.069018075422538, 1, 0, 0.3103273081924874, 1.07413471046053, 0, -21.86299424087795, 1, 0.3103273081924874, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9979496609411495, 2.00205033905885, 0, 1, 0.3326498869803832, 0, 0.4994879401834088, 10.16660373533207, 0.6673501130196168, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 10.17702622769927, 0.6666666666666667, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9277026861487137, 2.072297313851287, 1, 0, 0.3092342287162378, 1.077931556015455, 0, -21.94027543446793, 1, 0.3092342287162377, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9309823456974442, 2.016902062757016, 1, 0, 0.3158137215378628, 1.074134224587096, 0, -21.86298435138458, 1, 0.3158137215378628, 0.04913026544425401],
[1.928075561197303, 1.069873374086278, 1, 0, 0.6431315552127383, 0.5186518724292198, 0, -10.55666741751501, 1, 0.6431315552127383, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 2.131498424877468, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.015686607978273, 0, 0, 0.3163244507238016, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6343361203613463, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2407954381593249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.7849736408619979, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2616578802873326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6343361203613463, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2407954381593249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6343361203613463, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2407954381593249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.932622147706004, 1.067377852293997, 0, 0, 0.6442073825686678, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9309823772246257, 2.069017622775375, 1, 0, 0.3103274590748751, 1.07413418821216, 0, -21.86298361100722, 1, 0.3103274590748751, 0.04913026544425401],
[1.097938434326336, 1.780775571576737, 0, 0, 0.3813989274637599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 10.17702622769927, 0.6666666666666667, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.097938434326336, 1.780775571576737, 0, 0, 0.3813989274637599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 10.17702622769927, 0.6666666666666667, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.187119972330265, 1.476567674434805, 0, 0, 0.4456678596576327, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.543945526728802, 0, 0, 0.253186578827081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.187119972330265, 1.476567674434805, 0, 0, 0.4456678596576327, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9309822445457473, 2.069017755454253, 1, 0, 0.3103274148485823, 1.074134341292329, 0, -21.86298672680901, 1, 0.3103274148485824, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3180164715169775, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.930982672729219, 2.069017327270782, 1, 0, 0.3103275575764062, 1.074133847269631, 0, -21.86297667144511, 1, 0.3103275575764062, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 2.02792148665749, 0, 0, 0.1763689698354082, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.334262014801957, 0, 1, 0.221380517249299, 0, 0.4284009222867132, 8.719694844164872, 0.7786194827507009, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.462172274218755, 0, 0, 0.4061454230765794, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.543945526728802, 0, 0, 0.253186578827081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.932622147706004, 0, 0, 0.3409917642415111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.476567674434805, 2.523432325565196, 0, 0, 0.1588558914782683, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.932622147706004, 1.067377852293997, 0, 0, 0.6442073825686678, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 2.20008533280008, 0, 0, 0.1648425894497096, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.476567674434805, 2.523432325565196, 0, 0, 0.1588558914782683, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.015686607978273, 0, 0, 0.3163244507238016, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.186344521500557, 1.479212821306258, 1, 0, 0.4450643407473439, 0.8429254587319565, 0, -17.15694900302111, 1, 0.4450643407473438, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 10.17702622769927, 0.6666666666666667, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -20.35405245539854, 1, 0.3333333333333333, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6343361203613463, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2407954381593249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4347946085843651, 2.027377665634391, 1, 0, 0.1765898402549126, 2.299936522340676, 0, -46.813028619809, 1, 0.1765898402549126, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3180164715169775, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6343361203613463, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2407954381593249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.097938434326336, 1.780775571576737, 0, 0, 0.3813989274637599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6653267199927845, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2496229505381561, 1.503020951887886, 0, -30.59256729628907, 1, 0.2496229505381561, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -20.35405245539854, 1, 0.3333333333333333, 0.04913026544425401],
[0.6653276433486052, 2.334672356651396, 1, 0, 0.2217758811162017, 1.503018865963517, 0, -30.59252483927505, 1, 0.2217758811162016, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.004787105653950876, 2.995212894346049, 0, 1, 0.001595701884650292, 0, 0.3338660840729093, 6.795527788298493, 0.9984042981153497, 1, 0.04913026544425401],
[0.9843133920217289, 2.015686607978273, 0, 0, 0.3281044640072427, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.932622147706004, 0, 0, 0.3409917642415111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -20.35405245539854, 1, 0.3333333333333333, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.097938434326336, 1.780775571576737, 0, 0, 0.3813989274637599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 2.131498424877468, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3180164715169775, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.543945526728802, 0, 0, 0.253186578827081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6653275008278108, 2.33467249917219, 1, 0, 0.2217758336092702, 1.503019187927426, 0, -30.59253139254533, 1, 0.2217758336092702, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 2.131498424877468, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.996807649354729, 2.00319235064527, 0, 1, 0.3322692164515764, 0, 0.4992031841964049, 10.1608077970356, 0.6677307835484236, 1, 0.04913026544425401],
[0.6343361203613463, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2407954381593249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 1.633127064732731, 0, 0, 0.2100490662988453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401]
],
"RESOLVED": [
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.93873994865356, 0, 0, 0.2125896433186342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.462172274218755, 0, 0, 0.4061454230765794, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -20.35405245539854, 1, 0.3333333333333333, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 2.20008533280008, 0, 0, 0.1648425894497096, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9843133920217289, 2.015686607978273, 0, 0, 0.3281044640072427, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9986888007440505, 2.001311199255948, 0, 1, 0.3328962669146836, 0, 0.4996724149506493, 10.17035854442118, 0.6671037330853165, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.187119972330265, 1.476567674434805, 0, 0, 0.4456678596576327, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 1.633127064732731, 0, 0, 0.2100490662988453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.066966895388268, 0, 1, 0.3109166403488202, 0, 0.4838006850671672, 9.847304521814868, 0.6890833596511798, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6657378388866297, 2.334262161113371, 0, 1, 0.2219126129622098, 0, 0.4284008954345689, 8.719694297614916, 0.7780873870377901, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.930982377220105, 2.069017622779896, 1, 0, 0.3103274590733682, 1.074134188217376, 0, -21.86298361111339, 1, 0.3103274590733682, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.93873994865356, 0, 0, 0.2125896433186342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 10.17702622769927, 0.6666666666666667, 1, 0.04913026544425401],
[1.187119972330265, 1.476567674434805, 0, 0, 0.4456678596576327, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.476567674434805, 2.523432325565196, 0, 0, 0.1588558914782683, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 10.17702622769927, 0.6666666666666667, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -20.35405245539854, 1, 0.3333333333333333, 0.04913026544425401],
[0.476567674434805, 2.523432325565196, 0, 0, 0.1588558914782683, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 2.20008533280008, 0, 0, 0.1648425894497096, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.004787172664515901, 2.995212827335485, 0, 1, 0.0015957242215053, 0, 0.3338660915423467, 6.795527940331813, 0.9984042757784947, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6343361203613463, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2407954381593249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6343361203613463, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2407954381593249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9843133920217289, 2.015686607978273, 0, 0, 0.3281044640072427, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.543945526728802, 0, 0, 0.253186578827081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3180164715169775, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9309821300341614, 2.069017869965839, 1, 0, 0.3103273766780538, 1.074134473411757, 0, -21.86298941597478, 1, 0.3103273766780539, 0.04913026544425401],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9843133920217289, 2.015686607978273, 0, 0, 0.3281044640072427, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -20.35405245539854, 1, 0.3333333333333333, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.93873994865356, 0, 0, 0.2125896433186342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.93873994865356, 0, 0, 0.2125896433186342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.476567674434805, 2.523432325565196, 0, 0, 0.1588558914782683, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6343361203613463, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2407954381593249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 2.131498424877468, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.7849736408619979, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2616578802873326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999043604915482, 2.000095639508451, 0, 1, 0.3333014534971828, 0, 0.499976091266197, 10.1765395880773, 0.6666985465028172, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 2.02792148665749, 0, 0, 0.1763689698354082, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.996720286088885, 2, 0, 0.3336981448158886, 2.000000000000001, 0, -40.70810491079708, 0.9999999999999999, 0.1113544518535659, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6343361203613463, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2407954381593249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.93873994865356, 0, 0, 0.2125896433186342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -20.35405245539854, 1, 0.3333333333333333, 0.04913026544425401],
[0.6653275008308236, 2.334672499169177, 1, 0, 0.2217758336102745, 1.50301918792062, 0, -30.5925313924068, 1, 0.2217758336102745, 0.04913026544425401],
[1.187119972330265, 1.476567674434805, 0, 0, 0.4456678596576327, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.187119972330265, 1.476567674434805, 0, 0, 0.4456678596576327, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 1.633127064732731, 0, 0, 0.2100490662988453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.932622147706004, 1.067377852293997, 0, 0, 0.6442073825686678, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.932622147706004, 1.067377852293997, 0, 0, 0.6442073825686678, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 20.35405245539854, 0.4444444444444445, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 10.17702622769927, 0.6666666666666667, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 1, 0.2212292155883564, 0, 0.4280249593404618, 8.712042474635583, 0.7787707844116436, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6343361203613463, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2407954381593249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 10.17702622769927, 0.6666666666666667, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.462172274218755, 0, 0, 0.4061454230765794, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.543945526728802, 0, 0, 0.253186578827081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -20.35405245539854, 1, 0.3333333333333333, 0.04913026544425401],
[0.476567674434805, 2.523432325565196, 0, 0, 0.1588558914782683, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9309825803873458, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3176349755938541, 1.074133953810327, 0, -21.86297883998001, 1, 0.3176349755938541, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.462172274218755, 0, 0, 0.4061454230765794, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9979488310020711, 2.002051168997928, 0, 1, 0.3326496103340238, 0, 0.4994877331234859, 10.16659952082354, 0.6673503896659763, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 10.17702622769927, 0.6666666666666667, 1, 0.04913026544425401],
[0, 2.131498424877468, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.476567674434805, 2.523432325565196, 0, 0, 0.1588558914782683, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 2.20008533280008, 0, 0, 0.1648425894497096, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.7849736408619979, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2616578802873326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.543945526728802, 0, 0, 0.253186578827081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.187119972330265, 1.476567674434805, 0, 0, 0.4456678596576327, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9309819803545819, 2.069018019645418, 1, 0, 0.3103273267848606, 1.074134646106825, 0, -21.86299293101926, 1, 0.3103273267848605, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9995890752927575, 2.000410924707241, 0, 1, 0.3331963584309193, 0, 0.4998972899262431, 10.17493566147032, 0.6668036415690808, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6343361203613463, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2407954381593249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.187119972330265, 1.476567674434805, 0, 0, 0.4456678596576327, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 2.131498424877468, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.665327010053828, 2.334672989946172, 1, 0, 0.2217756700179426, 1.503020296619395, 0, -30.59255395891983, 1, 0.2217756700179426, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 2.02792148665749, 0, 0, 0.1763689698354082, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.097938434326336, 1.780775571576737, 0, 0, 0.3813989274637599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 2.20008533280008, 0, 0, 0.1648425894497096, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.476567674434805, 2.523432325565196, 0, 0, 0.1588558914782683, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.462172274218755, 0, 0, 0.4061454230765794, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4347947638396093, 2.027377510379147, 1, 0, 0.1765899033111195, 2.299935701086061, 0, -46.81301190394948, 1, 0.1765899033111195, 0.04913026544425401],
[0.9995890826417358, 2.000095667927829, 0, 1, 0.3332313778812721, 0, 0.4999760841620322, 10.17653944347876, 0.6667686221187279, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -20.35405245539854, 1, 0.3333333333333333, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.932622147706004, 1.067377852293997, 0, 0, 0.6442073825686678, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6343361203613463, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2407954381593249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -10.17702622769927, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.04913026544425401],
[0.9968081665258267, 2.003191833474172, 0, 1, 0.3322693888419424, 0, 0.4992033130774509, 10.16081042028717, 0.6677306111580577, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.015686607978273, 0, 0, 0.3163244507238016, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.932622147706004, 0, 0, 0.3409917642415111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 10.17702622769927, 0.6666666666666667, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 2.131498424877468, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.7849736408619979, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2616578802873326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.462172274218755, 0, 0, 0.4061454230765794, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6657385102348428, 2.334261489765158, 0, 1, 0.2219128367449475, 0, 0.4284010186453474, 8.719696805453566, 0.7780871632550524, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.930982345748919, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3176349209674398, 1.074134224527706, 0, -21.86298435017576, 1, 0.3176349209674398, 0.04913026544425401],
[0.9995891002602478, 2.000410899739751, 1, 1, 0.3331963667534161, 1.000411068647753, 0.4998972961655517, -10.18748357975212, 0.8889801811823229, 0.5553729146891553, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -40.70810491079708, 1, 0.1111111111111109, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.7849736408619979, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2616578802873326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.543945526728802, 0, 0, 0.253186578827081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.543945526728802, 0, 0, 0.253186578827081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 2.131498424877468, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9968089482895882, 2.003191051710411, 0, 1, 0.3322696494298628, 0, 0.4992035078961425, 10.16081438563704, 0.6677303505701372, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.932622147706004, 1.067377852293997, 0, 0, 0.6442073825686678, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.543945526728802, 0, 0, 0.253186578827081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.926936351584508, 1.073063648415493, 1, 0, 0.6423121171948358, 0.5189585007193964, 0, -10.56290854581757, 1, 0.6423121171948358, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.543945526728802, 0, 0, 0.253186578827081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9844090407543323, 2.015590959245669, 0, 1, 0.3281363469181106, 0, 0.4961324099083318, 10.09830509609747, 0.6718636530818893, 1, 0.04913026544425401],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5451545823574171, 2.454845417642583, 0, 0, 0.181718194119139, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.928075326414363, 1.069873502953494, 1, 0, 0.6431314996196631, 0.5186519355857832, 0, -10.55666870300701, 1, 0.6431314996196631, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 2.02792148665749, 0, 0, 0.1763689698354082, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9309826159407297, 2.016901862447166, 1, 0, 0.315813805719366, 1.074133912790123, 0, -21.86297800505263, 1, 0.315813805719366, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 2.20008533280008, 0, 0, 0.1648425894497096, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9979488891467502, 2.001311408560287, 0, 1, 0.332731670508789, 0, 0.4996723626931128, 10.17035748076854, 0.667268329491211, 1, 0.04913026544425401],
[0.9979492171500842, 2.002050782849915, 0, 1, 0.3326497390500281, 0, 0.4994878294627983, 10.16660148171895, 0.6673502609499719, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 2.131498424877468, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.7849736408619979, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2616578802873326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.93873994865356, 0, 0, 0.2125896433186342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 10.17702622769927, 0.6666666666666667, 1, 0.04913026544425401],
[0.476567674434805, 2.523432325565196, 0, 0, 0.1588558914782683, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.7849736408619979, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2616578802873326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.93873994865356, 0, 0, 0.2125896433186342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.932622147706004, 1.067377852293997, 0, 0, 0.6442073825686678, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 2.20008533280008, 0, 0, 0.1648425894497096, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.7849736408619979, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2616578802873326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6343361203613463, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2407954381593249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4356496599628513, 2.200915906492109, 0, 1, 0.1652337668008809, 0, 0.4543562964174457, 9.247991890721295, 0.8347662331991191, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.543945526728802, 0, 0, 0.253186578827081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.004784648491054112, 2.995215351508946, 0, 1, 0.001594882830351371, 0, 0.3338658101816333, 6.795522213501094, 0.9984051171696486, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 10.17702622769927, 0.6666666666666667, 1, 0.04913026544425401],
[1.187119972330265, 1.476567674434805, 0, 0, 0.4456678596576327, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.187119972330265, 1.476567674434805, 0, 0, 0.4456678596576327, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9309819344312159, 2.069018065568784, 1, 0, 0.310327311477072, 1.074134699091611, 0, -21.86299400947437, 1, 0.3103273114770719, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9309217135568477, 2.069078286443153, 1, 0, 0.3103072378522825, 1.074204184344588, 0, -21.86440831595834, 1, 0.3103072378522824, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999589079504434, 0, 1, 0.3333789974209437, 0, 0.5001027512351857, 10.17911763173009, 0.6666210025790562, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9309825370205005, 2.0690174629795, 1, 0, 0.3103275123401668, 1.074134003845423, 0, -21.86297985839699, 1, 0.3103275123401668, 0.04913026544425401],
[0.9309823175111835, 2.069017682488817, 1, 0, 0.3103274391703944, 1.074134257107399, 0, -21.86298501330454, 1, 0.3103274391703944, 0.04913026544425401],
[0.7849736408619979, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2616578802873326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.7849736408619979, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2616578802873326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 2.20008533280008, 0, 0, 0.1648425894497096, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.543945526728802, 0, 0, 0.253186578827081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6657376347107108, 2.33426236528929, 0, 1, 0.2219125449035702, 0, 0.4284008579627115, 8.719693534910766, 0.7780874550964297, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.93873994865356, 0, 0, 0.2125896433186342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 2.131498424877468, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4356496933190379, 2.200915926297183, 0, 1, 0.165233776120638, 0, 0.4543562923288934, 9.247991807502686, 0.8347662238793621, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 1.633127064732731, 0, 0, 0.2100490662988453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.476567674434805, 2.523432325565196, 0, 0, 0.1588558914782683, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.93873994865356, 0, 0, 0.2125896433186342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.93873994865356, 0, 0, 0.2125896433186342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.187119972330265, 1.476567674434805, 0, 0, 0.4456678596576327, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9309819245774625, 2.069018075422538, 1, 0, 0.3103273081924874, 1.07413471046053, 0, -21.86299424087795, 1, 0.3103273081924874, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9979496609411495, 2.00205033905885, 0, 1, 0.3326498869803832, 0, 0.4994879401834088, 10.16660373533207, 0.6673501130196168, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 10.17702622769927, 0.6666666666666667, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9277026861487137, 2.072297313851287, 1, 0, 0.3092342287162378, 1.077931556015455, 0, -21.94027543446793, 1, 0.3092342287162377, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9309823456974442, 2.016902062757016, 1, 0, 0.3158137215378628, 1.074134224587096, 0, -21.86298435138458, 1, 0.3158137215378628, 0.04913026544425401],
[1.928075561197303, 1.069873374086278, 1, 0, 0.6431315552127383, 0.5186518724292198, 0, -10.55666741751501, 1, 0.6431315552127383, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 2.131498424877468, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.015686607978273, 0, 0, 0.3163244507238016, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6343361203613463, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2407954381593249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.7849736408619979, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2616578802873326, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6343361203613463, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2407954381593249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6343361203613463, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2407954381593249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.932622147706004, 1.067377852293997, 0, 0, 0.6442073825686678, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9309823772246257, 2.069017622775375, 1, 0, 0.3103274590748751, 1.07413418821216, 0, -21.86298361100722, 1, 0.3103274590748751, 0.04913026544425401],
[1.097938434326336, 1.780775571576737, 0, 0, 0.3813989274637599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 10.17702622769927, 0.6666666666666667, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.097938434326336, 1.780775571576737, 0, 0, 0.3813989274637599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 10.17702622769927, 0.6666666666666667, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.187119972330265, 1.476567674434805, 0, 0, 0.4456678596576327, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.543945526728802, 0, 0, 0.253186578827081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.187119972330265, 1.476567674434805, 0, 0, 0.4456678596576327, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9309822445457473, 2.069017755454253, 1, 0, 0.3103274148485823, 1.074134341292329, 0, -21.86298672680901, 1, 0.3103274148485824, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3180164715169775, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.930982672729219, 2.069017327270782, 1, 0, 0.3103275575764062, 1.074133847269631, 0, -21.86297667144511, 1, 0.3103275575764062, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 2.02792148665749, 0, 0, 0.1763689698354082, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.334262014801957, 0, 1, 0.221380517249299, 0, 0.4284009222867132, 8.719694844164872, 0.7786194827507009, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.462172274218755, 0, 0, 0.4061454230765794, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.543945526728802, 0, 0, 0.253186578827081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.932622147706004, 0, 0, 0.3409917642415111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.476567674434805, 2.523432325565196, 0, 0, 0.1588558914782683, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.932622147706004, 1.067377852293997, 0, 0, 0.6442073825686678, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 2.20008533280008, 0, 0, 0.1648425894497096, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.476567674434805, 2.523432325565196, 0, 0, 0.1588558914782683, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.015686607978273, 0, 0, 0.3163244507238016, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.186344521500557, 1.479212821306258, 1, 0, 0.4450643407473439, 0.8429254587319565, 0, -17.15694900302111, 1, 0.4450643407473438, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 10.17702622769927, 0.6666666666666667, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -20.35405245539854, 1, 0.3333333333333333, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.215026359138003, 0, 0, 0.2305500460984022, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6343361203613463, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2407954381593249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4347946085843651, 2.027377665634391, 1, 0, 0.1765898402549126, 2.299936522340676, 0, -46.813028619809, 1, 0.1765898402549126, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3180164715169775, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6343361203613463, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2407954381593249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.097938434326336, 1.780775571576737, 0, 0, 0.3813989274637599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6653267199927845, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2496229505381561, 1.503020951887886, 0, -30.59256729628907, 1, 0.2496229505381561, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -20.35405245539854, 1, 0.3333333333333333, 0.04913026544425401],
[0.6653276433486052, 2.334672356651396, 1, 0, 0.2217758811162017, 1.503018865963517, 0, -30.59252483927505, 1, 0.2217758811162016, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.004787105653950876, 2.995212894346049, 0, 1, 0.001595701884650292, 0, 0.3338660840729093, 6.795527788298493, 0.9984042981153497, 1, 0.04913026544425401],
[0.9843133920217289, 2.015686607978273, 0, 0, 0.3281044640072427, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.932622147706004, 0, 0, 0.3409917642415111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -20.35405245539854, 1, 0.3333333333333333, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[1.097938434326336, 1.780775571576737, 0, 0, 0.3813989274637599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 2.131498424877468, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3180164715169775, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 2.110903794796152, 0, 0, 0.1986961046919849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.5234323255651956, 1.543945526728802, 0, 0, 0.253186578827081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6653275008278108, 2.33467249917219, 1, 0, 0.2217758336092702, 1.503019187927426, 0, -30.59253139254533, 1, 0.2217758336092702, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 1.999999999999999, 0, 0, 0.249161213617178, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0, 2.131498424877468, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9326221477060035, 2.067377852293997, 0, 0, 0.3108740492353345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.6636876467650693, 2.336312353234931, 0, 0, 0.2212292155883564, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.996807649354729, 2.00319235064527, 0, 1, 0.3322692164515764, 0, 0.4992031841964049, 10.1608077970356, 0.6677307835484236, 1, 0.04913026544425401],
[0.6343361203613463, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2407954381593249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401],
[0.4342507875612663, 1.633127064732731, 0, 0, 0.2100490662988453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04913026544425401]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node1":{
"Global MG94xREV":0.0005991687325333781,
"Nucleotide GTR":0.0006327406124545987,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "V", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GTT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1007":{
"Global MG94xREV":0.0005990145594322789,
"Nucleotide GTR":0.0006325778009173519,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAT", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node106":{
"Global MG94xREV":0.0005992358793774798,
"Nucleotide GTR":0.0006328115215874594,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "F", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "TTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node112":{
"Global MG94xREV":0.0005990482983591999,
"Nucleotide GTR":0.0006326134302620176,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAT", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node173":{
"Global MG94xREV":0.0005990485810561118,
"Nucleotide GTR":0.0006326137287986518,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTT", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node206":{
"Global MG94xREV":0.00059930758536981,
"Nucleotide GTR":0.0006328872453210929,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node245":{
"Global MG94xREV":0.0005993090689854243,
"Nucleotide GTR":0.0006328888120648191,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCT", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node248":{
"Global MG94xREV":0.0005991820458190034,
"Nucleotide GTR":0.0006327546716937464,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "I", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ATA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node251":{
"Global MG94xREV":0.000599122881330783,
"Nucleotide GTR":0.0006326921921742391,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "L", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CTT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node254":{
"Global MG94xREV":0.0005990313956366004,
"Nucleotide GTR":0.0006325955804670113,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "V", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GTT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node257":{
"Global MG94xREV":0.00059913517506858,
"Nucleotide GTR":0.0006327051747395187,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "V", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GTC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node260":{
"Global MG94xREV":0.0005990055504956217,
"Nucleotide GTR":0.0006325682872031212,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "G", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "GGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node263":{
"Global MG94xREV":0.0005991225295228399,
"Nucleotide GTR":0.0006326918206542303,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAT", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node266":{
"Global MG94xREV":0.0005990353082282646,
"Nucleotide GTR":0.000632599712284163,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGT", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node269":{
"Global MG94xREV":0.0005992275097548182,
"Nucleotide GTR":0.0006328026830084725,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCT", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node272":{
"Global MG94xREV":0.0005990352538767734,
"Nucleotide GTR":0.0006325996548873161,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACT", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node275":{
"Global MG94xREV":0.0005990352904153197,
"Nucleotide GTR":0.0006325996934731453,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "I", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ATA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node278":{
"Global MG94xREV":0.0005992722907318518,
"Nucleotide GTR":0.0006328499730977186,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "F", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "TTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node282":{
"Global MG94xREV":0.0005992675321791076,
"Nucleotide GTR":0.0006328449479196436,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node285":{
"Global MG94xREV":0.0005992661486304477,
"Nucleotide GTR":0.0006328434868496995,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "S", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "TCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node288":{
"Global MG94xREV":0.0005991413349177217,
"Nucleotide GTR":0.0006327116797296936,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "T", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ACC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node293":{
"Global MG94xREV":0.0005992615733450559,
"Nucleotide GTR":0.0006328386552075866,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "C", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "TGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node300":{
"Global MG94xREV":0.00059926049692657,
"Nucleotide GTR":0.0006328375184765532,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "TTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node303":{
"Global MG94xREV":0.0005992561484665624,
"Nucleotide GTR":0.0006328329263690238,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "L", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node309":{
"Global MG94xREV":0.0005992348258472123,
"Nucleotide GTR":0.0006328104090270898,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "I", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATT", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node313":{
"Global MG94xREV":0.0005767175840948737,
"Nucleotide GTR":0.0006090315090886333,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTT", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node314":{
"Global MG94xREV":2.228480639827572e-05,
"Nucleotide GTR":2.353344105467256e-05,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTT", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node318":{
"Global MG94xREV":0.0005991225278710572,
"Nucleotide GTR":0.0006326918189098962,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAT", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node323":{
"Global MG94xREV":0.0005992450869593364,
"Nucleotide GTR":0.0006328212450771328,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "V", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GTT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node328":{
"Global MG94xREV":0.0005989272459258657,
"Nucleotide GTR":0.000632485595168749,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "I", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATT", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node336":{
"Global MG94xREV":0.0005993192474135796,
"Nucleotide GTR":0.000632899560798047,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "Y", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "TAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node342":{
"Global MG94xREV":0.0005990641432925748,
"Nucleotide GTR":0.0006326301629990637,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAT", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node352":{
"Global MG94xREV":0.0003435876253043445,
"Nucleotide GTR":0.000362839101345765,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTG", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node353":{
"Global MG94xREV":0.0002554034072572799,
"Nucleotide GTR":0.0002697138544724713,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTG", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node365":{
"Global MG94xREV":0.0005988677724759805,
"Nucleotide GTR":0.0006324227893762201,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAC", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node414":{
"Global MG94xREV":0.0005989458963259271,
"Nucleotide GTR":0.0006325052905649146,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "G", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GGT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node417":{
"Global MG94xREV":0.0005992791309705189,
"Nucleotide GTR":0.0006328571966001619,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "I", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ATA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node422":{
"Global MG94xREV":0.0005990835550542482,
"Nucleotide GTR":0.0006326506624165112,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "I", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "ATC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node425":{
"Global MG94xREV":0.0005990484812294091,
"Nucleotide GTR":0.0006326136233785837,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "V", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GTC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node428":{
"Global MG94xREV":0.0005991530670736786,
"Nucleotide GTR":0.0006327240692472742,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAC", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node431":{
"Global MG94xREV":0.0005990484812294091,
"Nucleotide GTR":0.0006326136233785837,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "F", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TTT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node437":{
"Global MG94xREV":0.0005989737520063831,
"Nucleotide GTR":0.0006325347070203382,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAC", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node443":{
"Global MG94xREV":0.0005991530659728897,
"Nucleotide GTR":0.000632724068084808,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAC", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node446":{
"Global MG94xREV":0.000599048298302129,
"Nucleotide GTR":0.0006326134302017483,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGT", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node449":{
"Global MG94xREV":0.0005990484812294091,
"Nucleotide GTR":0.0006326136233785837,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTT", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node452":{
"Global MG94xREV":0.0005990482983669465,
"Nucleotide GTR":0.0006326134302701978,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "Y", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "TAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node473":{
"Global MG94xREV":0.0005993174008148509,
"Nucleotide GTR":0.000632897610732987,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node489":{
"Global MG94xREV":0.0005991882220772175,
"Nucleotide GTR":0.0006327611940124073,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCT", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node495":{
"Global MG94xREV":0.0005990743623768563,
"Nucleotide GTR":0.0006326409546664117,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "V", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node498":{
"Global MG94xREV":0.0005991371981857221,
"Nucleotide GTR":0.0006327073112134531,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTT", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node502":{
"Global MG94xREV":0.0005993408660325048,
"Nucleotide GTR":0.0006329223907246373,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "V", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GTT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node512":{
"Global MG94xREV":0.0005992914423712007,
"Nucleotide GTR":0.0006328701978179897,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node529":{
"Global MG94xREV":0.0005992432140189313,
"Nucleotide GTR":0.000632819267194452,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "I", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATT", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node532":{
"Global MG94xREV":0.000599134045320839,
"Nucleotide GTR":0.000632703981691152,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "S", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "TCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node536":{
"Global MG94xREV":0.0005992715276490329,
"Nucleotide GTR":0.0006328491672587891,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "N", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "AAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node541":{
"Global MG94xREV":0.0005991617869609217,
"Nucleotide GTR":0.0006327332777164334,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGT", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node544":{
"Global MG94xREV":0.0005992001055736525,
"Nucleotide GTR":0.0006327737433501885,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGA", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node548":{
"Global MG94xREV":0.0005991443453564079,
"Nucleotide GTR":0.0006327148588455504,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAT", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node551":{
"Global MG94xREV":0.000599205138759646,
"Nucleotide GTR":0.0006327790585494214,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAC", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node554":{
"Global MG94xREV":0.000599201698603715,
"Nucleotide GTR":0.0006327754256389367,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "L", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "CTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node565":{
"Global MG94xREV":0.0005990164683889722,
"Nucleotide GTR":0.0006325798168343419,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACT", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node575":{
"Global MG94xREV":0.0005991710047194683,
"Nucleotide GTR":0.0006327430119530035,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTT", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node580":{
"Global MG94xREV":0.0005992879114511435,
"Nucleotide GTR":0.000632866469057796,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTT", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node584":{
"Global MG94xREV":0.0005990926885158005,
"Nucleotide GTR":0.0006326603076328631,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "N", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAT", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node590":{
"Global MG94xREV":0.0005991539224702076,
"Nucleotide GTR":0.0006327249725723218,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "V", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GTC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node591":{
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node594":{
"Global MG94xREV":0.0005992909649016868,
"Nucleotide GTR":0.0006328696935954959,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "F", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "TTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node599":{
"Global MG94xREV":0.0005990546149715134,
"Nucleotide GTR":0.0006326201007989234,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTT", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node601":{
"Global MG94xREV":0.000599183907723975,
"Nucleotide GTR":0.0006327566379226698,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTT", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAA", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node624":{
"Global MG94xREV":0.0005993549684957183,
"Nucleotide GTR":0.0006329372833595944,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAA", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node636":{
"Global MG94xREV":0.0005992864801052537,
"Nucleotide GTR":0.000632864957512506,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node643":{
"Global MG94xREV":0.0005991069739127109,
"Nucleotide GTR":0.0006326753934514306,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "N", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAT", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node646":{
"Global MG94xREV":0.0005991340281421212,
"Nucleotide GTR":0.0006327039635498977,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAT", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node649":{
"Global MG94xREV":0.0004882211647452427,
"Nucleotide GTR":0.0005155765680362728,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACT", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node650":{
"Global MG94xREV":0.000110801465753971,
"Nucleotide GTR":0.0001170097561760356,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACT", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node661":{
"Global MG94xREV":0.0005991781438637285,
"Nucleotide GTR":0.0006327505511089491,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "F", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "TTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node666":{
"Global MG94xREV":0.0005990521957860872,
"Nucleotide GTR":0.0006326175460646982,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTT", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node685":{
"Global MG94xREV":0.0005992843111877074,
"Nucleotide GTR":0.0006328626670688593,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAT", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node707":{
"Global MG94xREV":0.0005989829658171716,
"Nucleotide GTR":0.0006325444370879553,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "S", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "TCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node71":{
"Global MG94xREV":0.0005990352852081435,
"Nucleotide GTR":0.0006325996879742071,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "L", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CTT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node727":{
"Global MG94xREV":0.0005991958053749811,
"Nucleotide GTR":0.0006327692022081139,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "S", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "TCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node747":{
"Global MG94xREV":0.00059921284378878,
"Nucleotide GTR":0.0006327871952972002,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAT", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node751":{
"Global MG94xREV":0.0005991340469494512,
"Nucleotide GTR":0.0006327039834110162,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGT", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node81":{
"Global MG94xREV":0.0005992739767447535,
"Nucleotide GTR":0.0006328517535792057,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "C", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "TGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node85":{
"Global MG94xREV":0.0005991783310040577,
"Nucleotide GTR":0.0006327507487348938,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "I", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ATT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node856":{
"Global MG94xREV":0.0005992736690689378,
"Nucleotide GTR":0.0006328514286640796,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGT", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406844_Victoria_20200125_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450610740598839,
"Nucleotide GTR":0.0006325731285180969,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCC", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406844_Victoria_20200125_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_407084_Aichi_20200125_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "L", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CTT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_407084_Aichi_20200125_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006453812550466818,
"Nucleotide GTR":0.0006328871110178252,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "Q", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAA", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408484_Sichuan_20200115_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006454082227201178,
"Nucleotide GTR":0.0006329135566153665,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "Y", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TAT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408484_Sichuan_20200115_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411956_Texas_20200211_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001292156141180788,
"Nucleotide GTR":0.001267140873369026,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "A", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAC", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTA", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GCT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411956_Texas_20200211_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450610740185382,
"Nucleotide GTR":0.0006325731284775504,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCC", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413596_NSW_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAY", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413596_NSW_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "L", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "ILVF", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CTT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "NTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414010_England_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "AS", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "KCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414010_England_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414578_Talca_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "VF", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "KTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414578_Talca_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415503_Noord_Brabant_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449546048912339,
"Nucleotide GTR":0.0006324687205204473,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "F", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TTT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415503_Noord_Brabant_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415594_Washington_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006456170130520313,
"Nucleotide GTR":0.0006331183049078522,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCA", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415594_Washington_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006454676458810517,
"Nucleotide GTR":0.0006329718293841476,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACC", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAT", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416374_Shanghai_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006451318703818582,
"Nucleotide GTR":0.0006326425542712224,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "E", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAG", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416374_Shanghai_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416395_Shanghai_20200209_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450610070355439,
"Nucleotide GTR":0.0006325730627913025,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "S", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TCA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416395_Shanghai_20200209_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006453063366537624,
"Nucleotide GTR":0.0006328136429942556,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "T", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "ACT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416495_Hauts_de_France_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450837484628466,
"Nucleotide GTR":0.0006325953639599736,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "A", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "GCA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416495_Hauts_de_France_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006454218318151065,
"Nucleotide GTR":0.0006329269022474926,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416702_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006454345286660265,
"Nucleotide GTR":0.0006329393532959767,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTG", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416702_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416746_ARA_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449546048862804,
"Nucleotide GTR":0.0006324687205155907,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "L", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CTC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416746_ARA_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416994_Castilla_y_Le_n_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452513482865591,
"Nucleotide GTR":0.0006327597191646021,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTT", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416994_Castilla_y_Le_n_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417242_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "LF", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTK", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417242_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417351_Washington_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006451633354150731,
"Nucleotide GTR":0.0006326734101627039,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "V", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GTT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417351_Washington_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417365_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006454126466455696,
"Nucleotide GTR":0.0006329178948966173,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "S", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "TCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417365_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417374_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006454834839058172,
"Nucleotide GTR":0.0006329873607954793,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAT", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417374_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417420_NanChang_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006454852228909624,
"Nucleotide GTR":0.0006329890661150497,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "N", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "AAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417420_NanChang_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417500_Minnesota_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTY", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417500_Minnesota_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417520_Taoyuan_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452513475674758,
"Nucleotide GTR":0.0006327597184594395,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "L", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TTA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417520_Taoyuan_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417689_Reykjavik_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452512740159503,
"Nucleotide GTR":0.0006327596463318223,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAT", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417689_Reykjavik_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417709_Reykjavik_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAC", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417709_Reykjavik_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00129159995477611,
"Nucleotide GTR":0.001266595454356477,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "L", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCA", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CTA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452284051572949,
"Nucleotide GTR":0.000632737220198783,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "I", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "ATT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417939_California_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "N", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "AAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417939_California_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417972_Madrid_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006451784767323381,
"Nucleotide GTR":0.0006326882583543197,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCC", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417972_Madrid_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418065_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "I", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ATA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418065_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418078_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "KQE", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "I", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "-AG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ATA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418078_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418080_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450317291186459,
"Nucleotide GTR":0.0006325443516750485,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "F", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTT", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418080_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418309_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000645083599449377,
"Nucleotide GTR":0.0006325952178313044,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "G", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GGT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418309_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418330_Ontario_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006451696999988461,
"Nucleotide GTR":0.0006326796515324451,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "T", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ACC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418330_Ontario_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418341_Ontario_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006455020981201693,
"Nucleotide GTR":0.000633005614651248,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "F", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "TTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418341_Ontario_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006454087664683499,
"Nucleotide GTR":0.0006329140898370006,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCT", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000645403957541205,
"Nucleotide GTR":0.0006329093740074288,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "K", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "AAG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418390_Finland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449502666470039,
"Nucleotide GTR":0.000632464466261689,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "I", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "ATC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418390_Finland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418737_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACY", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418737_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418835_British_Columbia_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006454588590279729,
"Nucleotide GTR":0.0006329632126385933,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACT", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418835_British_Columbia_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418850_British_Columbia_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450773594375082,
"Nucleotide GTR":0.0006325890986218389,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "I", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "ATT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418850_British_Columbia_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418874_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006454514913217133,
"Nucleotide GTR":0.0006329559875661381,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "T", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "ACA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418874_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418928_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452648758003278,
"Nucleotide GTR":0.0006327729847948648,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAC", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418928_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418977_New_York_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452512764657039,
"Nucleotide GTR":0.0006327596487341496,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "Y", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "TAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418977_New_York_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452513506489723,
"Nucleotide GTR":0.000632759721481281,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "S", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "TCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419405_Wales_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "KR", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "ARG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419405_Wales_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "EV", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GWG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419675_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450610070828658,
"Nucleotide GTR":0.000632573062837708,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGC", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419675_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006453063394112203,
"Nucleotide GTR":0.000632813645698331,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAA", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419819_Victoria_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452015496775608,
"Nucleotide GTR":0.0006327108846229493,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGC", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419819_Victoria_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419952_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACY", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419952_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419987_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449501675297781,
"Nucleotide GTR":0.0006324643690633048,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "F", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "TTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419987_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419994_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGT", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419994_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420102_Singapore_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452513475544685,
"Nucleotide GTR":0.0006327597184466835,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAT", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420102_Singapore_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "AV", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GYC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAR", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420191_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452513471750318,
"Nucleotide GTR":0.0006327597180745938,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAT", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420191_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420287_England_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "S", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "TCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420287_England_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420355_Ronse_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000644957362221294,
"Nucleotide GTR":0.0006324714244704655,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "Y", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "TAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420355_Ronse_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420372_Vorst_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487997752352522,
"Nucleotide GTR":0.0006362394509706549,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "C", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "Q", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "TGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAG", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420372_Vorst_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420415_Montignies_Sur_Sambre_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAT", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420415_Montignies_Sur_Sambre_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "HP", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CMT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420694_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "ILVF", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "TTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "NTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420694_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420718_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAY", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420718_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420727_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449502640937151,
"Nucleotide GTR":0.0006324644637578292,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "D", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAT", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420727_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420730_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAY", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420730_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421189_Li_ge_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006455571949301446,
"Nucleotide GTR":0.0006330596448242954,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "S", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "TCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421189_Li_ge_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421196_Li_ge_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452511780759057,
"Nucleotide GTR":0.0006327595522491113,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "V", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GTT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421196_Li_ge_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421305_Wisconsin_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450611624062435,
"Nucleotide GTR":0.000632573215154131,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATC", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421305_Wisconsin_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452513475832814,
"Nucleotide GTR":0.000632759718474939,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "Y", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "TAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450611623150223,
"Nucleotide GTR":0.0006325732150646747,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "L", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "CTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421489_Portugal_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450911737381576,
"Nucleotide GTR":0.0006326026454869828,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "S", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "TCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421489_Portugal_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421514_Centre__Val_de_Loire_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450610041367373,
"Nucleotide GTR":0.0006325730599486152,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAC", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421514_Centre__Val_de_Loire_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421616_New_York_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006450837483683054,
"Nucleotide GTR":0.0006325953638672629,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "R", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AGA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421616_New_York_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421631_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001290761272051988,
"Nucleotide GTR":0.001265773007961916,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "V", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAC", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GTT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421631_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421688_Minnesota_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006454041109641894,
"Nucleotide GTR":0.000632909524460248,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "L", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CTA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421688_Minnesota_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421707_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006455215888607541,
"Nucleotide GTR":0.0006330247280642946,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421707_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421728_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450882562364882,
"Nucleotide GTR":0.000632599784466171,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "C", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TGT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421728_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421743_Luxembourg_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "V", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GTT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421743_Luxembourg_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421893_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "TI", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "AYA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421893_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "VL", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "KTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAA", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006455743982986899,
"Nucleotide GTR":0.0006330765151472744,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "H", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAT", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTT", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAA", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422255_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAY", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422255_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422332_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006456446070036902,
"Nucleotide GTR":0.0006331453646592935,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "G", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "GG-", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422332_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422424_Dasman_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "AV", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GYA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422424_Dasman_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422426_Dasman_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTY", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422426_Dasman_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422505_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449546049215381,
"Nucleotide GTR":0.0006324687205501662,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "F", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "TTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422505_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422573_Friesland_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452197451788548,
"Nucleotide GTR":0.0006327287278716604,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAT", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422573_Friesland_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422713_Netherlands_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001290586153216438,
"Nucleotide GTR":0.001265601279308427,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "F", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "F", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "F", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "TTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "TTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "TTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422713_Netherlands_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422741_Netherlands_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450296022030705,
"Nucleotide GTR":0.0006325422659351177,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAC", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422741_Netherlands_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422775_Netherlands_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006454086477712954,
"Nucleotide GTR":0.0006329139734378411,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAA", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422775_Netherlands_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422860_Noord_Brabant_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452747775908886,
"Nucleotide GTR":0.0006327826948934669,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTA", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422860_Noord_Brabant_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422925_Zuid_Holland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006457179148914072,
"Nucleotide GTR":0.0006332172533559514,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "H", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAC", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422925_Zuid_Holland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422947_Zuid_Holland_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGT", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422947_Zuid_Holland_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422954_Zuid_Holland_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006450655142124706,
"Nucleotide GTR":0.0006325774827123367,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAC", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422954_Zuid_Holland_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423008_Washington_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006450914516764267,
"Nucleotide GTR":0.0006326029180445561,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "G", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "GGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423008_Washington_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423011_Washington_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006457603910793085,
"Nucleotide GTR":0.0006332589072336204,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGA", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423011_Washington_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423027_Washington_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452062180982233,
"Nucleotide GTR":0.000632715462666149,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCC", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423027_Washington_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423055_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452197891026808,
"Nucleotide GTR":0.0006327287709451504,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "I", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ATT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423055_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423124_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "S", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "TCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423124_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423136_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452747768677558,
"Nucleotide GTR":0.0006327826941843327,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAA", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423136_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423153_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "CF", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TKT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423153_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423158_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006453033381547968,
"Nucleotide GTR":0.0006328107025441998,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "F", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "V", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "TTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GTC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423158_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423178_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTR", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423178_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423363_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006455614191694987,
"Nucleotide GTR":0.000633063787285236,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "S", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "TCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "TTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423363_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423387_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "KQ", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "MAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423387_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423399_England_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006452196450927251,
"Nucleotide GTR":0.0006327286297231299,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "I", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ATA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423399_England_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423454_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "GV", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GKT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423454_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423457_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTG", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423457_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423461_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "QH", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAN", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTG", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423461_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423467_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "SG", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "RGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423467_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423469_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452715142220868,
"Nucleotide GTR":0.0006327794947012752,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "I", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAT", "ATT", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423469_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423492_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "AG", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GST", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423492_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423494_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "DG", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GRT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423494_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423530_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "DA", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GMC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423530_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423567_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "RG", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "SGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423567_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423569_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "GV", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GKG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423569_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423579_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGK", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423579_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423778_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAY", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423778_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423783_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "KR", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "ARA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423783_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423803_England_20200324_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "C", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "TGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423803_England_20200324_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423804_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "SRGC", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "C", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "NGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "TGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423804_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423808_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452197898432982,
"Nucleotide GTR":0.0006327287716714306,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAT", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423808_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423825_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "SF", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TYT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423825_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423845_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452197863887973,
"Nucleotide GTR":0.0006327287682838064,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "Y", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "TAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423845_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424181_USA_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000645248802281235,
"Nucleotide GTR":0.0006327572224482157,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "V", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GTC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424181_USA_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424220_Washington_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006453964799762979,
"Nucleotide GTR":0.0006329020412031145,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "L", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CTA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424220_Washington_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424277_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000648347868010144,
"Nucleotide GTR":0.0006357962923633819,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "A", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GCT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424277_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424286_Oregon_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00064520211252224,
"Nucleotide GTR":0.0006327114365713369,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "I", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATT", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424286_Oregon_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424339_Washington_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006452513475664578,
"Nucleotide GTR":0.0006327597184584418,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "L", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CTT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424339_Washington_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCT", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424491_Reykjavik_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006449547063441059,
"Nucleotide GTR":0.0006324688200092613,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "I", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATT", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424491_Reykjavik_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424663_Li_ge_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006452196421453814,
"Nucleotide GTR":0.0006327286268328449,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAT", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424663_Li_ge_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424849_Arizona_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "KR", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "ARA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424849_Arizona_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424893_Virginia_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCK", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424893_Virginia_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424947_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006454894736662895,
"Nucleotide GTR":0.0006329932345982458,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGA", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424947_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424955_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000645473341800897,
"Nucleotide GTR":0.0006329774150348416,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGA", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424955_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425061_Ghent_20200325_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0006450295993743963,
"Nucleotide GTR":0.0006325422631612046,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAC", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425061_Ghent_20200325_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425146_Wisconsin_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452197891024755,
"Nucleotide GTR":0.0006327287709449496,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAT", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425146_Wisconsin_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425218_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452415649513881,
"Nucleotide GTR":0.0006327501252281748,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "R", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CGT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425218_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425279_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450295993743963,
"Nucleotide GTR":0.0006325422631612046,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "T", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ACG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425279_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425425_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006457179626609453,
"Nucleotide GTR":0.0006332173002007039,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "T", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "ACT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425425_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425436_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "C", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "DAGV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "TGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GNT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425436_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425491_England_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006450521889996913,
"Nucleotide GTR":0.000632564415466652,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTG", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425491_England_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425658_Scotland_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006451308611559043,
"Nucleotide GTR":0.0006326415645831992,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "L", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "P", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "CTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "CCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425658_Scotland_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425699_Scotland_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450913936842095,
"Nucleotide GTR":0.0006326028611750288,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGT", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425699_Scotland_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425724_Scotland_20200312_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006452472136563623,
"Nucleotide GTR":0.0006327556645780457,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "D", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAT", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425724_Scotland_20200312_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425788_Scotland_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "RI", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AKA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425788_Scotland_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425810_Scotland_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000645030346497164,
"Nucleotide GTR":0.0006325429958201814,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTC", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425810_Scotland_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425863_Scotland_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006454087641844787,
"Nucleotide GTR":0.0006329140875973448,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "L", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "TTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425863_Scotland_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426072_Idaho_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449547087443423,
"Nucleotide GTR":0.0006324688223630304,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "I", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATT", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426072_Idaho_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426096_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006453392706778362,
"Nucleotide GTR":0.0006328459394379271,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "G", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "GGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426096_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426325_New_York_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000645857726354622,
"Nucleotide GTR":0.0006333543581639217,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACA", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426325_New_York_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426469_Virginia_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "SL", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TYA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426469_Virginia_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426530_Arizona_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000645219789155862,
"Nucleotide GTR":0.0006327287709973025,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAT", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426530_Arizona_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426668_Victoria_20200322_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000645052133316789,
"Nucleotide GTR":0.0006325643608617318,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "C", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TGT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426668_Victoria_20200322_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001293814875759839,
"Nucleotide GTR":0.001268767495969962,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "L", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "I", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTA", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ATC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGN", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426754_Victoria_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "V", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GTC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426754_Victoria_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426817_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450296029641274,
"Nucleotide GTR":0.0006325422666814411,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTC", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426817_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426833_Victoria_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006452197891024755,
"Nucleotide GTR":0.0006327287709449496,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATT", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426833_Victoria_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426878_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001290582958256112,
"Nucleotide GTR":0.00126559814620037,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "Y", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "I", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "TAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATT", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426878_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006451974645862007,
"Nucleotide GTR":0.0006327068786161907,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCT", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426927_Victoria_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006452513475832814,
"Nucleotide GTR":0.000632759718474939,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "V", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GTT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426927_Victoria_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000645219742444285,
"Nucleotide GTR":0.0006327287251900304,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCT", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427129_Victoria_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "F", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "TTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427129_Victoria_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427140_Victoria_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450294685024829,
"Nucleotide GTR":0.0006325421348228825,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTC", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427140_Victoria_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427288_Ohio_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449714576856546,
"Nucleotide GTR":0.0006324852470561818,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "L", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "CTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427288_Ohio_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427349_Liege_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452288147331889,
"Nucleotide GTR":0.0006327376218455646,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "R", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AGG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427349_Liege_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427376_Liege_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000645219642091041,
"Nucleotide GTR":0.0006327286267795568,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "TTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427376_Liege_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427417_Doha_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "AV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GYT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427417_Doha_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427452_Wisconsin_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006449547062412174,
"Nucleotide GTR":0.0006324688199083646,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTT", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427452_Wisconsin_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427457_Wisconsin_20200413_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006449502663344907,
"Nucleotide GTR":0.0006324644659552251,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "C", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "TGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427457_Wisconsin_20200413_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427493_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452196392605866,
"Nucleotide GTR":0.0006327286240038987,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "TTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427493_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427610_New_York_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAY", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427610_New_York_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427664_New_South_Wales_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006455579584119174,
"Nucleotide GTR":0.000633060393525578,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "S", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAT", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427664_New_South_Wales_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427695_New_South_Wales_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006449545068696578,
"Nucleotide GTR":0.0006324686243965036,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "I", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATT", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427695_New_South_Wales_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427710_New_South_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450295388005997,
"Nucleotide GTR":0.0006325422037600752,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTC", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427710_New_South_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427721_New_South_Wales_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006450294660153668,
"Nucleotide GTR":0.0006325421323839159,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAC", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427721_New_South_Wales_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450421499180123,
"Nucleotide GTR":0.0006325545707347962,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "L", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTT", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "CTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427740_New_South_Wales_20200321_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006452196450927251,
"Nucleotide GTR":0.0006327286297231299,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "F", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "TTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427740_New_South_Wales_20200321_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427756_New_South_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450342696696585,
"Nucleotide GTR":0.0006325468430427131,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAC", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427756_New_South_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427765_New_South_Wales_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006451498364305771,
"Nucleotide GTR":0.0006326601725094055,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "Y", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "TAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427765_New_South_Wales_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427773_New_South_Wales_20200325_null_13":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "S", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "TCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427773_New_South_Wales_20200325_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427800_New_South_Wales_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006451157604650657,
"Nucleotide GTR":0.000632626756231509,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "Y", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "TAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427800_New_South_Wales_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428231_New_Taipei_City_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006451987391976469,
"Nucleotide GTR":0.0006327081285520234,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "I", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "ATC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428231_New_Taipei_City_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428260_Wisconsin_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000644971139070672,
"Nucleotide GTR":0.0006324849346093692,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "H", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAT", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428260_Wisconsin_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449264746918878,
"Nucleotide GTR":0.0006324411349027109,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "I", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATC", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428752_Connecticut_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449502661028708,
"Nucleotide GTR":0.0006324644657280887,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "V", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GTA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428752_Connecticut_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428761_New_York_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006453011026801296,
"Nucleotide GTR":0.0006328085103468072,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACT", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428761_New_York_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428767_New_York_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000645319862088843,
"Nucleotide GTR":0.0006328269065860726,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "S", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "AGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428767_New_York_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428794_New_York_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000645274777538,
"Nucleotide GTR":0.0006327826948416019,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "I", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "ATC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428794_New_York_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428850_Singapore_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006453919727558926,
"Nucleotide GTR":0.0006328976212394433,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGT", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428850_Singapore_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428861_Moscow_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "I", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "ATC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428861_Moscow_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428866_Lipetsk_Region_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006450476814997265,
"Nucleotide GTR":0.000632559995228834,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "V", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "GTA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428866_Lipetsk_Region_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428904_Moscow_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450611458847505,
"Nucleotide GTR":0.0006325731989524821,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTG", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428904_Moscow_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428924_Chelyabinsk_Region_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000645093927766627,
"Nucleotide GTR":0.0006326053461993272,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "I", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "ATA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428924_Chelyabinsk_Region_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428926_Malopolskie_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006450611618948975,
"Nucleotide GTR":0.000632573214652684,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAC", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428926_Malopolskie_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428992_California_20200408_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0006452197891026808,
"Nucleotide GTR":0.0006327287709451504,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "L", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CTT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428992_California_20200408_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429037_California_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCT", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429037_California_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429182_Bangkok_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "KE", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "RAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429182_Bangkok_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429229_Abruzzo_20200321_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "IV", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "RTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429229_Abruzzo_20200321_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429294_Unknown_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450476801584911,
"Nucleotide GTR":0.0006325599939135646,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "E", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "GAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429294_Unknown_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429336_Unknown_20200303_null_11":{
"Global MG94xREV":0.0006452199375441817,
"Nucleotide GTR":0.0006327289165129246,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "I", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ATC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429336_Unknown_20200303_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429382_Unknown_20200309_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0006453663219849527,
"Nucleotide GTR":0.0006328724670500576,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAT", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429382_Unknown_20200309_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429452_Unknown_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006453323692224035,
"Nucleotide GTR":0.0006328391715899983,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATC", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429452_Unknown_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429463_Unknown_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450566518413015,
"Nucleotide GTR":0.0006325687919106716,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "T", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ACT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429463_Unknown_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429530_Unknown_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006452195448577152,
"Nucleotide GTR":0.0006327285314286026,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAT", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429530_Unknown_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429565_Unknown_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452702729713578,
"Nucleotide GTR":0.0006327782774803193,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "Y", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TAC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429565_Unknown_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429612_Washington_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006455490032702957,
"Nucleotide GTR":0.0006330516117494336,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "I", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "ATC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429612_Washington_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429644_Washington_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006452333136872947,
"Nucleotide GTR":0.0006327420337029662,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "I", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ATT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429644_Washington_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429782_Luxembourg_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006454039048419009,
"Nucleotide GTR":0.000632909322328348,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "N", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "AAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429782_Luxembourg_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429789_Luxembourg_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006454043107403949,
"Nucleotide GTR":0.0006329097203689222,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATT", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429789_Luxembourg_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429982_Virginia_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449502657240534,
"Nucleotide GTR":0.0006324644653566066,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "L", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CTC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429982_Virginia_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430008_Amman_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "AV", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GYT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430008_Amman_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430070_St_Petersburg_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006451274304091541,
"Nucleotide GTR":0.0006326382002533831,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "C", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TGT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430070_St_Petersburg_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430109_St_Petersburg_20200415_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006449547062712179,
"Nucleotide GTR":0.0006324688199377844,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "F", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TTC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430109_St_Petersburg_20200415_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430124_Washington_20200306_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006454914288648656,
"Nucleotide GTR":0.0006329951519455012,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "L", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CTT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430124_Washington_20200306_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430148_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001291197925499872,
"Nucleotide GTR":0.001266201208094762,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "V", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCC", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GTT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430148_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430191_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006455277486620096,
"Nucleotide GTR":0.0006330307686159701,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "TTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430191_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430326_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452747803267033,
"Nucleotide GTR":0.0006327826975763179,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "D", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GAC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430326_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430341_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450296002375244,
"Nucleotide GTR":0.0006325422640076236,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAC", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430341_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006485013602259309,
"Nucleotide GTR":0.0006359468130738192,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "S", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "A", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "TCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "GCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006454085944258813,
"Nucleotide GTR":0.0006329139211251583,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "Y", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TAT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430414_New_York_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452288062541921,
"Nucleotide GTR":0.0006327376135307154,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "S", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "TCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430414_New_York_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430439_Malaysia_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006458062747878261,
"Nucleotide GTR":0.0006333039026646146,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "L", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTA", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430439_Malaysia_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430474_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTY", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430474_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430492_Victoria_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "DG", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GRT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430492_Victoria_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "PL", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CYC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430514_Victoria_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006452197898432982,
"Nucleotide GTR":0.0006327287716714306,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "I", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ATA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430514_Victoria_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430525_Victoria_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGY", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430525_Victoria_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430537_Victoria_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAY", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430537_Victoria_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430547_Victoria_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "HY", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "YAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430547_Victoria_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006452738037915464,
"Nucleotide GTR":0.0006327817399462206,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "I", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ATT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430652_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCW", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430652_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430653_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "DG", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GRT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430653_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430654_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006456383721002319,
"Nucleotide GTR":0.0006331392504593451,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATA", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430654_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430706_Victoria_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "TP", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "MCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430706_Victoria_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "TI", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "AYT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430731_Beijing_20200204_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "RC", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "YGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430731_Beijing_20200204_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430819_Egypt_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450955515245785,
"Nucleotide GTR":0.0006326069385224241,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "S", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "TCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430819_Egypt_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430859_Norrbotten_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "I", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ATA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430859_Norrbotten_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430892_Washington_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006456081381261518,
"Nucleotide GTR":0.0006331096017945274,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "I", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ATA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430892_Washington_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430934_Washington_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006453278127475801,
"Nucleotide GTR":0.0006328347033254412,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "I", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "ATT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430934_Washington_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431013_Alaska_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "HL", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CWT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431013_Alaska_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431901_Wales_20200404_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAR", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431901_Wales_20200404_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431986_Wales_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "NS", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "ART", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431986_Wales_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432009_Wales_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000645251347859536,
"Nucleotide GTR":0.0006327597187458458,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "V", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GTA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432009_Wales_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432034_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450610070849257,
"Nucleotide GTR":0.0006325730628397286,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGC", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432034_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432040_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAR", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAC", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432040_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432077_Wales_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "MI", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATK", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432077_Wales_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432110_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452468384877036,
"Nucleotide GTR":0.0006327552966723981,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "F", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "TTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432110_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432209_Wales_20200402_null_4":{
"Global MG94xREV":0.000645215232610871,
"Nucleotide GTR":0.0006327243026639361,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTT", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432209_Wales_20200402_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432236_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTY", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432236_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432315_Wales_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006449547061548571,
"Nucleotide GTR":0.0006324688198236759,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "L", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "TTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432315_Wales_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432336_Wales_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "VF", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "KTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432336_Wales_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432393_Wales_20200402_null_13":{
"Global MG94xREV":0.0006451624267232836,
"Nucleotide GTR":0.0006326725190625713,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "L", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "TTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432393_Wales_20200402_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432442_Wales_20200330_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "HY", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "YAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432442_Wales_20200330_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432600_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "G", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "GGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432600_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432733_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450475352585369,
"Nucleotide GTR":0.0006325598518187749,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGG", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432733_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432896_Scotland_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00064582735410786,
"Nucleotide GTR":0.0006333245739032887,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "Y", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TAT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432896_Scotland_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432990_England_20200401_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0006450296029920361,
"Nucleotide GTR":0.0006325422667088097,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTC", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432990_England_20200401_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433071_Scotland_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433071_Scotland_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433161_Scotland_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006454582022593418,
"Nucleotide GTR":0.0006329625685845585,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "V", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "A", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GTT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "GCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433161_Scotland_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433180_Scotland_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006455225713415082,
"Nucleotide GTR":0.0006330256915248868,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCC", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433180_Scotland_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433353_Scotland_20200326_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006450837484170563,
"Nucleotide GTR":0.0006325953639150692,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAG", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433353_Scotland_20200326_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433394_Scotland_20200407_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0006452513476369147,
"Nucleotide GTR":0.0006327597185275346,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTT", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433394_Scotland_20200407_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433424_Scotland_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006451559338769827,
"Nucleotide GTR":0.0006326661519133781,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATC", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433424_Scotland_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433507_Scotland_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452242968030865,
"Nucleotide GTR":0.0006327331913795283,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "L", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CTT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433507_Scotland_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433567_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450610070790832,
"Nucleotide GTR":0.0006325730628339981,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAC", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433567_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433677_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "V", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GTT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433677_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433679_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "V", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "DAGV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GTT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GNT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433679_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433715_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006451835541299658,
"Nucleotide GTR":0.0006326932374569676,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAA", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433715_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433746_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450566545984554,
"Nucleotide GTR":0.0006325687946144488,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGC", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433746_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433766_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452747776086381,
"Nucleotide GTR":0.0006327826949108723,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "K", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AAA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433766_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433787_England_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006452197891026808,
"Nucleotide GTR":0.0006327287709451504,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACT", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433787_England_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433793_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452792878868764,
"Nucleotide GTR":0.0006327871178731794,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACA", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433793_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433858_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452513475534504,
"Nucleotide GTR":0.0006327597184456862,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGT", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433858_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434127_Washington_20200308_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006455752693922721,
"Nucleotide GTR":0.0006330773693770768,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGT", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434127_Washington_20200308_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434221_Washington_20200406_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAT", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434221_Washington_20200406_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434242_Washington_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001291401209545405,
"Nucleotide GTR":0.001266400556698843,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "Y", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "S", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "TAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "TCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAT", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434242_Washington_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434244_Washington_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006454182086542026,
"Nucleotide GTR":0.0006329233492285301,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "C", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "TGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434244_Washington_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434270_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006454472209430427,
"Nucleotide GTR":0.0006329517998591061,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAT", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434270_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434283_Washington_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449502660366568,
"Nucleotide GTR":0.0006324644656631583,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "C", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGT", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434283_Washington_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434315_Washington_20200330_null_6":{
"Global MG94xREV":0.000645593442644192,
"Nucleotide GTR":0.0006330951908071463,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACT", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434315_Washington_20200330_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006453188537083578,
"Nucleotide GTR":0.0006328259177271502,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "I", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATT", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434354_Ghent_20200327_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCT", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434354_Ghent_20200327_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434461_Athens_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACT", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434461_Athens_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434462_Athens_20200323_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "F", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "TTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434462_Athens_20200323_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434502_Luxembourg_20200413_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0006452197918547373,
"Nucleotide GTR":0.0006327287736439293,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTT", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434502_Luxembourg_20200413_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434531_Louisiana_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006449502666470039,
"Nucleotide GTR":0.000632464466261689,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "V", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GTT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434531_Louisiana_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434539_Costa_Rica_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006457179625650457,
"Nucleotide GTR":0.0006332173001066605,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "CGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434539_Costa_Rica_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434541_Puerto_Rico_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006453642021866274,
"Nucleotide GTR":0.0006328703882895926,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "Y", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "TAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434541_Puerto_Rico_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434557_Manila_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006479556392800099,
"Nucleotide GTR":0.000635411656915835,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "-", "I", "T", "R", "C", "N", "-", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTT", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "---", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "---", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434557_Manila_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434606_Virginia_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "KN", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAK", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434606_Virginia_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434619_Occitanie_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006454733424519483,
"Nucleotide GTR":0.0006329774156732893,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "T", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "ACT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434619_Occitanie_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434630_Occitanie_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450565695432575,
"Nucleotide GTR":0.0006325687112058614,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "L", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "CTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434630_Occitanie_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434675_Stockholm_20200420_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "V", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GTC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434675_Stockholm_20200420_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434694_Samut_Prakarn_20200122_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006452467698999753,
"Nucleotide GTR":0.000632755229412482,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTT", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434694_Samut_Prakarn_20200122_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434697_Nonthaburi_20200303_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006452747300660845,
"Nucleotide GTR":0.0006327826482887116,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "D", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GAT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434697_Nonthaburi_20200303_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434833_Texas_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006454082252103547,
"Nucleotide GTR":0.0006329135590573942,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCA", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434833_Texas_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434998_Texas_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006449547062412174,
"Nucleotide GTR":0.0006324688199083646,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "F", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "TTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434998_Texas_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435022_Texas_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449547062712179,
"Nucleotide GTR":0.0006324688199377844,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "H", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAT", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435022_Texas_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435023_Texas_20200403_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006450521889770494,
"Nucleotide GTR":0.0006325644154444489,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "V", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "GTC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435023_Texas_20200403_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435037_Louisiana_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450295993460223,
"Nucleotide GTR":0.0006325422631333795,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCC", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435037_Louisiana_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435047_Nur_Sultan_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000645221344887283,
"Nucleotide GTR":0.0006327302966108162,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "S", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AGT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTT", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAA", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435047_Nur_Sultan_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.01107015903582772,
"Nucleotide GTR":0.01085584825389159,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "F", "Q", "V", "Y", "G", "F", "L", "Y", "L", "F", "F", "T", "R", "V", "E", "A", "F", "S", "L", "F", "R", "A", "C", "F", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TTT", "CAA", "GTT", "TAT", "GGT", "TTC", "CTT", "TAC", "TTG", "TTT", "TTC", "ACC", "CGC", "GTA", "GAA", "GCT", "TTT", "AGT", "CTT", "TTT", "CGT", "GCT", "TGT", "TTT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 1.5, 1, 1, 1.5, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0.5, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004573231673790465,
"Nucleotide GTR":0.004484697005696429,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "K", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "E", "A", "Q", "P", "C", "S", "E", "K", "A", "K", "K", "I", "Q", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "AAA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAA", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAA", "AAA", "GCA", "AAA", "AAA", "ATA", "CAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435071_Delhi_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "V", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GTT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435071_Delhi_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435077_Maharashtra_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "QH", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAW", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435077_Maharashtra_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435100_Uttar_Pradesh_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000645056499245754,
"Nucleotide GTR":0.0006325686422692696,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCC", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435100_Uttar_Pradesh_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435103_Ladakh_20200317_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "LF", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTK", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435103_Ladakh_20200317_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435108_Delhi_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCW", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435108_Delhi_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435109_Delhi_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTR", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435109_Delhi_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435110_Delhi_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "AS", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "KCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435110_Delhi_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435112_Bihar_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTY", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435112_Bihar_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435122_United_Arab_Emirates_20200314_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "G", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GGT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435122_United_Arab_Emirates_20200314_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435127_United_Arab_Emirates_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450971209962776,
"Nucleotide GTR":0.0006326084776102132,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "V", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "GTA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435127_United_Arab_Emirates_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435133_United_Arab_Emirates_20200310_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAT", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435133_United_Arab_Emirates_20200310_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435145_Abruzzo_20200324_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "L", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435145_Abruzzo_20200324_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435287_Israel_20200301_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "EG", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GRA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435287_Israel_20200301_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435429_Szeged_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006450609798625586,
"Nucleotide GTR":0.0006325730361443682,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTC", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435429_Szeged_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435471_Louisiana_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449640897476936,
"Nucleotide GTR":0.0006324780217565097,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAT", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAC", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435471_Louisiana_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435475_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001291112318985381,
"Nucleotide GTR":0.001266117258864417,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "V", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAT", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GTT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435475_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435537_New_York_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000645296997708655,
"Nucleotide GTR":0.0006328044848448006,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "N", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAT", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435537_New_York_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435543_New_York_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGA", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435543_New_York_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435544_New_York_20200422_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006452197891026808,
"Nucleotide GTR":0.0006327287709451504,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "S", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "TCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435544_New_York_20200422_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435637_California_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450296002375244,
"Nucleotide GTR":0.0006325422640076236,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "T", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ACA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435637_California_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435674_Brunei_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTY", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435674_Brunei_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435698_Singapore_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "VF", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "KTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435698_Singapore_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436046_Virginia_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449501671273221,
"Nucleotide GTR":0.00063246436866864,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "S", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "TCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436046_Virginia_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436076_New_York_20200309_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006449547549486823,
"Nucleotide GTR":0.0006324688676728866,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "F", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "TTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436076_New_York_20200309_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436077_New_York_20200319_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0006453493205792544,
"Nucleotide GTR":0.0006328557947800609,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAT", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436077_New_York_20200319_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436081_New_York_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006451274273370869,
"Nucleotide GTR":0.0006326381972407887,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "C", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TGT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436081_New_York_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436107_New_Taipei_City_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006450566540886983,
"Nucleotide GTR":0.0006325687941145607,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAC", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436107_New_Taipei_City_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "L", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "EG", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "CTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GRA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436123_Victoria_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000645163394871259,
"Nucleotide GTR":0.0006326734684678573,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "L", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "CTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436123_Victoria_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436130_Victoria_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGY", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436130_Victoria_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436157_Karnataka_20200417_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006452286591053575,
"Nucleotide GTR":0.0006327374692305834,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCG", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436157_Karnataka_20200417_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436254_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAT", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436254_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436305_Comunitat_Valenciana_20200326_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACT", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436305_Comunitat_Valenciana_20200326_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436346_Comunitat_Valenciana_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "IV", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "RTA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436346_Comunitat_Valenciana_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436354_Comunitat_Valenciana_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449546049108264,
"Nucleotide GTR":0.0006324687205396613,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "C", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "TGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436354_Comunitat_Valenciana_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436373_Comunitat_Valenciana_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006457489161125555,
"Nucleotide GTR":0.0006332476544144531,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "E", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAA", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436373_Comunitat_Valenciana_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436374_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006450523392913352,
"Nucleotide GTR":0.0006325645628487514,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAG", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436374_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436392_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAC", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436392_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436421_Assam_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "KN", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAM", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436421_Assam_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "LF", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "YTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436437_Delhi_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGY", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436437_Delhi_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436444_Maharashtra_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006457579821325229,
"Nucleotide GTR":0.0006332565449224132,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "N", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTY", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AAT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436444_Maharashtra_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436462_Madhya_Pradesh_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "TI", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "AYT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436462_Madhya_Pradesh_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436620_Wisconsin_20200425_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450610070447972,
"Nucleotide GTR":0.0006325730628003765,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAC", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436620_Wisconsin_20200425_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436630_Wisconsin_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00064521974526553,
"Nucleotide GTR":0.0006327287279566575,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "M", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ATG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436630_Wisconsin_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436658_California_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["AV", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GYT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436658_California_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436671_California_20200418_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006453063366369494,
"Nucleotide GTR":0.0006328136429777683,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "S", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "AGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436671_California_20200418_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436717_Moscow_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTT", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436717_Moscow_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436731_Abruzzo_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006453602486994225,
"Nucleotide GTR":0.0006328665113392229,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCG", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436731_Abruzzo_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436732_Abruzzo_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452197891423969,
"Nucleotide GTR":0.0006327287709840984,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAT", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436732_Abruzzo_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436808_Michigan_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAY", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436808_Michigan_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436809_Michigan_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006453916855985799,
"Nucleotide GTR":0.0006328973396413022,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "L", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436809_Michigan_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436834_Michigan_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCY", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436834_Michigan_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436871_Michigan_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGY", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436871_Michigan_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436940_LA_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000644950266639801,
"Nucleotide GTR":0.0006324644662546255,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "I", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "ATA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436940_LA_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437140_Michigan_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450609823681048,
"Nucleotide GTR":0.000632573038601408,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTC", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437140_Michigan_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437279_Bavaria_20200401_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "N", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAT", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437279_Bavaria_20200401_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437319_Kocaeli_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452747300078772,
"Nucleotide GTR":0.0006327826482316299,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "S", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "AGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437319_Kocaeli_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437340_Kinshasa_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006453805416869718,
"Nucleotide GTR":0.0006328864114682757,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "S", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "TCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437340_Kinshasa_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437378_Minnesota_20200413_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAC", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437378_Minnesota_20200413_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437440_Gujarat_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450785622689082,
"Nucleotide GTR":0.0006325902781672373,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "I", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATT", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437440_Gujarat_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437514_Alaska_20200323_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0006449502657240534,
"Nucleotide GTR":0.0006324644653566066,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "F", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTT", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437514_Alaska_20200323_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437526_Oregon_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006458274049660832,
"Nucleotide GTR":0.000633324623776931,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "H", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CAT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437526_Oregon_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437528_Oregon_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452197891719206,
"Nucleotide GTR":0.0006327287710130502,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "I", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ATA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437528_Oregon_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437531_Oregon_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452062182248823,
"Nucleotide GTR":0.0006327154627903556,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAC", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437531_Oregon_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437546_Louisiana_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006450610765448729,
"Nucleotide GTR":0.0006325731309549778,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCC", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437546_Louisiana_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437557_California_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450881078301876,
"Nucleotide GTR":0.0006325996389329155,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "T", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ACG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437557_California_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437571_California_20200425_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "N", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAT", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437571_California_20200425_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437597_California_20200326_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006452197898590111,
"Nucleotide GTR":0.0006327287716868393,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "TTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437597_California_20200326_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437626_Telengana_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "TM", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "AYG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437626_Telengana_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437671_Unknown_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGT", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437671_Unknown_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437740_Madinah_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000645457719258028,
"Nucleotide GTR":0.0006329620949338235,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "N", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "AAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437740_Madinah_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437747_Madinah_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450296001938744,
"Nucleotide GTR":0.0006325422639648179,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "CTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437747_Madinah_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437793_Virginia_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006452513499564733,
"Nucleotide GTR":0.0006327597208021883,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAT", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437793_Virginia_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437823_Washington_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTT", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437823_Washington_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437857_Washington_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452060540124994,
"Nucleotide GTR":0.000632715301757013,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGC", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437857_Washington_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437874_Athens_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006450297562915615,
"Nucleotide GTR":0.00063254241704056,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTC", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437874_Athens_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437930_Ischgl_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "MV", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "RTG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437930_Ischgl_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437939_Strass_im_Zillertal_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGY", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437939_Strass_im_Zillertal_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437948_Innsbruck_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000645219937583898,
"Nucleotide GTR":0.0006327289165518726,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "C", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "TGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437948_Innsbruck_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437967_St__Anton_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "TI", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "AYT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437967_St__Anton_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438052_Vienna_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452512735231185,
"Nucleotide GTR":0.0006327596458485312,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "TTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438052_Vienna_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438062_Vienna_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "SF", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TYT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438062_Vienna_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438092_Vienna_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "AV", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GYT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438092_Vienna_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438174_Washington_20200427_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "T", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ACC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438174_Washington_20200427_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438221_Washington_20200422_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006452288116980195,
"Nucleotide GTR":0.000632737618869154,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438221_Washington_20200422_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438225_Maryland_20200321_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "F", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "TTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438225_Maryland_20200321_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438226_Maryland_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006458008953437475,
"Nucleotide GTR":0.0006332986273629305,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "N", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "AAT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438226_Maryland_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438245_District_of_Columbia_20200314_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "S", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "TCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438245_District_of_Columbia_20200314_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438577_England_20200420_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "DAGV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTT", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GNT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438577_England_20200420_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438597_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "T", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "DAGV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ACC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GNT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438597_England_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438608_England_20200420_null_20":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "V", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438608_England_20200420_null_20",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438625_England_20200421_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006450296024606177,
"Nucleotide GTR":0.0006325422661876785,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "T", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ACC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438625_England_20200421_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438717_England_20200425_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006457600193554028,
"Nucleotide GTR":0.0006332585427060381,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "DAGV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGG", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GNT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438717_England_20200425_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438883_Scotland_20200318_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006454085946087374,
"Nucleotide GTR":0.0006329139213044736,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "Y", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TAT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438883_Scotland_20200318_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438906_Scotland_20200318_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTT", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438906_Scotland_20200318_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439085_Scotland_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTT", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439085_Scotland_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439146_Scotland_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "F", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "DAGV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "TTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GNT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439146_Scotland_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439224_Scotland_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449501675225061,
"Nucleotide GTR":0.0006324643690561735,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "F", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TTC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439224_Scotland_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439301_Scotland_20200427_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0006450296029621859,
"Nucleotide GTR":0.0006325422666795366,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACC", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439301_Scotland_20200427_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439545_England_20200328_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "I", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ATT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439545_England_20200328_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439709_England_20200408_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAA", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439709_England_20200408_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439807_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450836019614942,
"Nucleotide GTR":0.0006325952202947877,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAG", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439807_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440303_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "IL", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "MTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTT", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAA", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440303_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440403_England_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCK", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440403_England_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440995_England_20200402_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACT", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440995_England_20200402_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440999_England_20200402_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAT", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440999_England_20200402_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441033_England_20200406_null_44":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "I", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ATA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441033_England_20200406_null_44",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441037_England_20200404_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "L", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CTT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441037_England_20200404_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441296_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452747773533688,
"Nucleotide GTR":0.000632782694660545,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAA", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441296_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441354_England_20200420_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006449502660678647,
"Nucleotide GTR":0.0006324644656937608,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "I", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATT", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441354_England_20200420_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441414_Northern_Ireland_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "RC", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "YGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441414_Northern_Ireland_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441432_Northern_Ireland_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452196421431363,
"Nucleotide GTR":0.0006327286268306441,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "V", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GTT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441432_Northern_Ireland_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441690_Northern_Ireland_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452928140885584,
"Nucleotide GTR":0.0006328003822167565,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "I", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "ATT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441690_Northern_Ireland_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441883_England_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450296029299344,
"Nucleotide GTR":0.0006325422666479095,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAC", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441883_England_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441884_England_20200430_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006450429859345674,
"Nucleotide GTR":0.0006325553905666362,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCC", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441884_England_20200430_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441927_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006451633423441912,
"Nucleotide GTR":0.0006326734169576789,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTC", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441927_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442005_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006451328257545279,
"Nucleotide GTR":0.0006326434911485242,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "I", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATT", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGT", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442005_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442155_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450341104808499,
"Nucleotide GTR":0.0006325466869356922,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCC", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442155_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442387_England_20200410_null_5":{
"Global MG94xREV":0.000645052338649944,
"Nucleotide GTR":0.0006325645622197772,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "A", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "GCA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442387_England_20200410_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442392_England_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006449547549424224,
"Nucleotide GTR":0.0006324688676667475,
"amino-acid": [
["S", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442392_England_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442496_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "V", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GTT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442496_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442502_England_20200409_null_14":{
"Global MG94xREV":0.0006449547545357515,
"Nucleotide GTR":0.0006324688672679495,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "I", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "ATC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442502_England_20200409_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442510_England_20200326_null_46":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "V", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GTC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442510_England_20200326_null_46",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442516_England_20200408_null_12":{
"Global MG94xREV":0.0006451814816884933,
"Nucleotide GTR":0.0006326912051365601,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "I", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATT", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442516_England_20200408_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442523_Semnan_20200309_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0006452513506029316,
"Nucleotide GTR":0.0006327597214361312,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "I", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ATA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442523_Semnan_20200309_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442641_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450294660153668,
"Nucleotide GTR":0.0006325421323839159,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "S", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TCG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442641_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442700_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449547546549304,
"Nucleotide GTR":0.0006324688673848206,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "L", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "TTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442700_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442736_England_20200405_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "Y", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "TAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442736_England_20200405_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443203_Singapore_20200318_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTT", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443203_Singapore_20200318_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443230_Singapore_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452197428989496,
"Nucleotide GTR":0.0006327287256358932,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "S", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "TCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443230_Singapore_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443232_Singapore_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "HY", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "YAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443232_Singapore_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443236_Singapore_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAC", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443236_Singapore_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006454513339688028,
"Nucleotide GTR":0.0006329558332594731,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAA", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443248_Singapore_20200320_null_85":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443248_Singapore_20200320_null_85",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443254_Minnesota_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452196421738403,
"Nucleotide GTR":0.0006327286268607536,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGT", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443254_Minnesota_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443261_Bourgogne_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006450792411628359,
"Nucleotide GTR":0.0006325909439182391,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTG", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443261_Bourgogne_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443270_Bretagne_20200323_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "C", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "TGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443270_Bretagne_20200323_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443292_Bretagne_20200403_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006451195525852365,
"Nucleotide GTR":0.0006326304749388011,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "S", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "TCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443292_Bretagne_20200403_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443294_Bretagne_20200406_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0006450296024341878,
"Nucleotide GTR":0.0006325422661617613,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "T", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ACA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443294_Bretagne_20200406_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444054_California_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006451938795095734,
"Nucleotide GTR":0.0006327033629442196,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCT", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444054_California_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444057_California_20200428_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAT", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444057_California_20200428_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444065_California_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006454699022793083,
"Nucleotide GTR":0.0006329740421000625,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "V", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GTT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444065_California_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444069_California_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTR", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444069_California_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444125_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006451885432167026,
"Nucleotide GTR":0.0006326981299583651,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "L", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTT", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444125_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444151_England_20200409_null_11":{
"Global MG94xREV":0.0006452197898590111,
"Nucleotide GTR":0.0006327287716868393,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAT", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444151_England_20200409_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444173_England_20200411_null_15":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "F", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "TTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444173_England_20200411_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444183_England_20200414_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000644954703550748,
"Nucleotide GTR":0.000632468817269981,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "F", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "TTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444183_England_20200414_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444184_England_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450295994425972,
"Nucleotide GTR":0.0006325422632280842,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCC", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444184_England_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444198_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006454674655445039,
"Nucleotide GTR":0.000632971652538793,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "L", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "I", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "CTC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ATA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444198_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444212_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452197890849026,
"Nucleotide GTR":0.0006327287709277179,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "L", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CTG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444212_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444220_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006450296002111075,
"Nucleotide GTR":0.0006325422639817172,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "T", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ACC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444220_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444234_England_20200416_null_28":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTT", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444234_England_20200416_null_28",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444242_England_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452512764405742,
"Nucleotide GTR":0.0006327596487095064,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "L", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CTA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444242_England_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444248_England_20200418_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGT", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444248_England_20200418_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444261_England_20200418_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "I", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATT", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444261_England_20200418_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444265_England_20200418_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGT", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444265_England_20200418_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444282_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452067001432535,
"Nucleotide GTR":0.0006327159353791136,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "M", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATG", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444282_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444320_England_20200420_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0006452216281496468,
"Nucleotide GTR":0.0006327305743894128,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "V", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444320_England_20200420_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444328_England_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006459990519193328,
"Nucleotide GTR":0.0006334929477614093,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "DAGV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTT", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTT", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GNT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444328_England_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444342_England_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "N", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "DAGV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAT", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GNT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444342_England_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444348_England_20200426_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006453102884755639,
"Nucleotide GTR":0.0006328175183114643,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "V", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444348_England_20200426_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444427_England_20200419_null_16":{
"Global MG94xREV":0.0006452512735804576,
"Nucleotide GTR":0.0006327596459047597,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "S", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "TCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444427_England_20200419_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444434_England_20200101_null_50":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTT", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAA", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444434_England_20200101_null_50",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444439_England_20200416_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "DAGV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTT", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GNT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAA", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444439_England_20200416_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444451_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006454599274352638,
"Nucleotide GTR":0.0006329642603622431,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "V", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACT", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444451_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444458_Gujarat_20200426_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTT", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444458_Gujarat_20200426_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444480_Gujarat_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452286617295019,
"Nucleotide GTR":0.0006327374718039254,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "R", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AGA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444480_Gujarat_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444491_Stockholm_20200301_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "I", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATT", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444491_Stockholm_20200301_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444593_Illinois_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006455503035566893,
"Nucleotide GTR":0.0006330528868631624,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTT", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444593_Illinois_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444681_New_York_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "F", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TTT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444681_New_York_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444699_New_York_20200330_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTT", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444699_New_York_20200330_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444709_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452746215410605,
"Nucleotide GTR":0.0006327825418646569,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "I", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "ATT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444709_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444712_New_York_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAC", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444712_New_York_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444720_New_York_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006452513506489723,
"Nucleotide GTR":0.000632759721481281,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "L", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CTA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444720_New_York_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444730_New_York_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006453608710153746,
"Nucleotide GTR":0.0006328671216075593,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAT", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444730_New_York_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444744_New_Jersey_20200402_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAT", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444744_New_Jersey_20200402_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444766_New_York_20200403_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "I", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATT", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444766_New_York_20200403_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444782_New_York_20200318_null_174":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444782_New_York_20200318_null_174",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444793_Queensland_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449547061278151,
"Nucleotide GTR":0.0006324688197971588,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "C", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGT", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444793_Queensland_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444850_Unknown_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452512739599279,
"Nucleotide GTR":0.000632759646276884,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCT", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444850_Unknown_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444855_Unknown_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006449547062869191,
"Nucleotide GTR":0.0006324688199531813,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "Y", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "TAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444855_Unknown_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444918_Unknown_20200330_null_441":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444918_Unknown_20200330_null_441",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444942_Unknown_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452513475832814,
"Nucleotide GTR":0.000632759718474939,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "S", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "TCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444942_Unknown_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444976_Catalonia_20200406_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAT", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444976_Catalonia_20200406_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444978_Catalonia_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006449547063441832,
"Nucleotide GTR":0.000632468820009337,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCT", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444978_Catalonia_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445084_Texas_20200325_null_196":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "L", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "CTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445084_Texas_20200325_null_196",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445116_California_20200331_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAT", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445116_California_20200331_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445125_Louisiana_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "Y", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "TAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445125_Louisiana_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445144_Louisiana_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006458274079932241,
"Nucleotide GTR":0.0006333246267454693,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "N", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "AAT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445144_Louisiana_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445161_Louisiana_20200407_null_13467":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445161_Louisiana_20200407_null_13467",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445172_California_20200325_null_1189":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445172_California_20200325_null_1189",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445174_California_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006451707909874157,
"Nucleotide GTR":0.0006326807214002145,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCT", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445174_California_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445182_California_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006452562871403728,
"Nucleotide GTR":0.0006327645624055505,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "H", "D", "L", "Y", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "S", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "TCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445182_California_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 407, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 415, 416, 417, 418, 419, 420, 421, 422, 423, 424, 425, 426, 427, 428, 429, 430, 431, 432, 433, 434, 435, 436, 437, 438, 439, 440, 441, 442, 443, 444, 445, 446, 447, 448, 449, 450, 451, 452, 453, 454, 455, 456, 457, 458, 459, 460, 461, 462, 463, 464, 465, 466, 467, 468, 469, 470, 471, 472, 473, 474, 475, 476, 477, 478, 479, 480, 481, 482, 483, 484, 485, 486, 487, 488, 489, 490, 491, 492, 493, 494, 495, 496, 497, 498, 499, 500, 501, 502, 503, 504, 505, 506, 507, 508, 509, 510, 511, 512, 513, 514, 515, 516, 517, 518, 519, 520, 521, 522, 523, 524, 525, 526]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":12779.89324488136,
"Equilibrium frequencies": [
[0.02961234300516416],
[0.01559258931430504],
[0.01208527191136741],
[0.04280108285423512],
[0.01704426027410158],
[0.008974776179441224],
[0.006956035863312577],
[0.02463542976162841],
[0.01620104753953684],
[0.008530776531309119],
[0.006611907228352302],
[0.02341666709534571],
[0.02360839231050939],
[0.01243116647691719],
[0.009634963380404749],
[0.03412309370998379],
[0.01766492441428214],
[0.009301591286177763],
[0.007209338849111742],
[0.02553252518173374],
[0.01016756996860564],
[0.005353806107719379],
[0.004149548305820434],
[0.01469600040012471],
[0.009664560489799833],
[0.005088942897710846],
[0.003944262073511723],
[0.01396896065270998],
[0.01408333226570892],
[0.00741567852830168],
[0.005747633674901867],
[0.02035576418465806],
[0.03055362387659362],
[0.01608822743571446],
[0.01246942372516377],
[0.0441615912260358],
[0.01758604233305177],
[0.009260055366623259],
[0.007177145807161721],
[0.02541851061375893],
[0.01671602658538357],
[0.008801942401769295],
[0.006822078432860802],
[0.02416100741335556],
[0.02435882695471197],
[0.01282631316329175],
[0.009941227789314128],
[0.03520775679718366],
[0.01542524832487677],
[0.04234173800720204],
[0.01686133982895625],
[0.008878458121196267],
[0.00688138309715543],
[0.0243710402424663],
[0.0084392235149008],
[0.006540947679857984],
[0.02316535744036413],
[0.0233550250442769],
[0.01229775414519584],
[0.009531560137192099],
[0.03375688177759207]
],
"Log Likelihood":-5781.559475470519,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *background*": [
[0.5763747705923091, 1]
],
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.500467302119005, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":607
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":13834.24617389552,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2934850276645057],
[0.182557610426756],
[0.199773233559433],
[0.3241841283493053]
],
"Log Likelihood":-5898.82728286049,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.2318586077000033,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.4304939710306199,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.1033674806257716,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":3.787094685338277,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":1.121235330344054
},
"display order":0,
"estimated parameters":1017
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-05-15/sequences.exonuclease.compressed.fas",
"number of sequences":506,
"number of sites":527,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"((epi_isl_433161_Scotland_20200417_null_1,epi_isl_435071_Delhi_20200325_null_4)Node1,(epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_1,epi_isl_436254_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1)Node1007,epi_isl_428767_New_York_20200405_null_1,epi_isl_429463_Unknown_20200323_null_1,epi_isl_429644_Washington_20200408_null_2,epi_isl_430414_New_York_20200410_null_1,epi_isl_433507_Scotland_20200329_null_1,epi_isl_433793_England_20200406_null_1,epi_isl_435544_New_York_20200422_null_4,epi_isl_429294_Unknown_20200313_null_1,epi_isl_441690_Northern_Ireland_20200327_null_1,epi_isl_432393_Wales_20200402_null_13,(epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1,epi_isl_439709_England_20200408_null_4)Node624,epi_isl_425724_Scotland_20200312_null_3,epi_isl_437948_Innsbruck_20200324_null_2,epi_isl_420355_Ronse_20200306_null_1,((epi_isl_428761_New_York_20200403_null_1,epi_isl_440995_England_20200402_null_3)Node650,epi_isl_418737_England_20200317_null_1)Node649,(epi_isl_436077_New_York_20200319_null_7,epi_isl_444976_Catalonia_20200406_null_9)Node646,(epi_isl_445182_California_20200412_null_1,epi_isl_417420_NanChang_20200323_null_1,epi_isl_427610_New_York_20200316_null_1,epi_isl_444782_New_York_20200318_null_174)Node636,(epi_isl_435537_New_York_20200420_null_1,epi_isl_437279_Bavaria_20200401_null_7)Node643,epi_isl_437528_Oregon_20200419_null_1,epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1,epi_isl_427452_Wisconsin_20200410_null_2,epi_isl_430341_New_York_20200330_null_1,epi_isl_433424_Scotland_20200408_null_1,(epi_isl_433677_England_20200402_null_1,epi_isl_433679_England_20200402_null_1)Node502,(epi_isl_435112_Bihar_20200328_null_3,epi_isl_444348_England_20200426_null_2,epi_isl_430654_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_443248_Singapore_20200320_null_85,epi_isl_435077_Maharashtra_20200329_null_1,epi_isl_428850_Singapore_20200415_null_1,epi_isl_436157_Karnataka_20200417_null_3,epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_1)Node473,(epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_1,epi_isl_434354_Ghent_20200327_null_4)Node489,epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2,epi_isl_427417_Doha_20200323_null_3,(epi_isl_438608_England_20200420_null_20,epi_isl_438717_England_20200425_null_1)Node495,(epi_isl_444234_England_20200416_null_28,epi_isl_444320_England_20200420_null_6)Node498,(epi_isl_419952_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_426325_New_York_20200306_null_1,epi_isl_418835_British_Columbia_20200311_null_2,epi_isl_436305_Comunitat_Valenciana_20200326_null_7,epi_isl_444451_England_20200415_null_1)Node565,(epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1,epi_isl_427288_Ohio_20200331_null_1,epi_isl_445084_Texas_20200325_null_196,epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1,epi_isl_425658_Scotland_20200315_null_1,epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_1)Node554,(epi_isl_427773_New_South_Wales_20200325_null_13,epi_isl_437340_Kinshasa_20200415_null_1)Node532,(epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1,epi_isl_437626_Telengana_20200324_null_1,epi_isl_421189_Li_ge_20200330_null_3,epi_isl_444918_Unknown_20200330_null_441,epi_isl_428231_New_Taipei_City_20200324_null_1,epi_isl_430819_Egypt_20200318_null_1,epi_isl_419819_Victoria_20200317_null_1,epi_isl_427349_Liege_20200406_null_1,epi_isl_444480_Gujarat_20200430_null_1)Node512,(epi_isl_437440_Gujarat_20200426_null_1,epi_isl_444491_Stockholm_20200301_null_2)Node529,(epi_isl_417939_California_20200318_null_1,epi_isl_437740_Madinah_20200420_null_1)Node536,epi_isl_427765_New_South_Wales_20200322_null_1,(epi_isl_419994_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_423579_England_20200331_null_1)Node541,(epi_isl_424947_New_York_20200401_null_1,epi_isl_435543_New_York_20200422_null_1)Node544,(epi_isl_420415_Montignies_Sur_Sambre_20200325_null_1,epi_isl_435475_New_York_20200330_null_1)Node548,(epi_isl_435471_Louisiana_20200403_null_1,epi_isl_437378_Minnesota_20200413_null_3)Node551,(epi_isl_432236_Wales_20200401_null_1,epi_isl_443203_Singapore_20200318_null_6,epi_isl_444328_England_20200427_null_1)Node575,(epi_isl_436717_Moscow_20200414_null_2,epi_isl_438577_England_20200420_null_3)Node580,(epi_isl_437571_California_20200425_null_2,epi_isl_444342_England_20200427_null_1)Node584,epi_isl_433715_England_20200404_null_1,(epi_isl_438225_Maryland_20200321_null_4,epi_isl_439146_Scotland_20200407_null_1)Node594,(epi_isl_423158_England_20200324_null_2,epi_isl_442510_England_20200326_null_46)Node590,epi_isl_423530_England_20200325_null_1,(epi_isl_430439_Malaysia_20200305_null_1,(epi_isl_444439_England_20200416_null_5,epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1,epi_isl_444434_England_20200101_null_50,epi_isl_435047_Nur_Sultan_20200325_null_1,epi_isl_440303_England_20200318_null_1)Node601,epi_isl_444699_New_York_20200330_null_4)Node599,epi_isl_428260_Wisconsin_20200316_null_2,epi_isl_429565_Unknown_20200324_null_1,(epi_isl_414578_Talca_20200304_null_1,epi_isl_434462_Athens_20200323_null_4)Node661,epi_isl_428904_Moscow_20200322_null_1,(epi_isl_425810_Scotland_20200305_null_1,epi_isl_439085_Scotland_20200324_null_1)Node666,epi_isl_421631_New_York_20200318_null_1,epi_isl_429336_Unknown_20200303_null_11,epi_isl_406844_Victoria_20200125_null_1,epi_isl_437526_Oregon_20200420_null_1,epi_isl_444151_England_20200409_null_11,epi_isl_432315_Wales_20200407_null_2,epi_isl_437140_Michigan_20200320_null_1,epi_isl_433787_England_20200406_null_2,epi_isl_432209_Wales_20200402_null_4,(epi_isl_436373_Comunitat_Valenciana_20200316_null_1,epi_isl_427664_New_South_Wales_20200317_null_2,epi_isl_444057_California_20200428_null_5)Node685,epi_isl_427756_New_South_Wales_20200325_null_1,epi_isl_436630_Wisconsin_20200325_null_2,epi_isl_444942_Unknown_20200329_null_1,epi_isl_445144_Louisiana_20200331_null_2,epi_isl_444212_England_20200416_null_1,epi_isl_442700_England_20200406_null_1,epi_isl_444427_England_20200419_null_16,(epi_isl_407084_Aichi_20200125_null_1,epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1)Node71,epi_isl_436123_Victoria_20200411_null_2,epi_isl_428866_Lipetsk_Region_20200311_null_2,epi_isl_442155_England_20200404_null_1,(epi_isl_423124_England_20200324_null_1,epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1)Node707,epi_isl_435127_United_Arab_Emirates_20200315_null_1,epi_isl_437319_Kocaeli_20200319_null_1,epi_isl_408484_Sichuan_20200115_null_1,epi_isl_432034_Wales_20200330_null_1,epi_isl_444220_England_20200415_null_1,epi_isl_444183_England_20200414_null_3,epi_isl_444720_New_York_20200403_null_2,epi_isl_432733_England_20200401_null_1,(epi_isl_420287_England_20200320_null_2,epi_isl_423363_England_20200329_null_1)Node727,epi_isl_418080_Washington_20200315_null_1,epi_isl_432990_England_20200401_null_6,epi_isl_422925_Zuid_Holland_20200323_null_1,epi_isl_433746_England_20200327_null_1,epi_isl_428992_California_20200408_null_8,epi_isl_444793_Queensland_20200324_null_1,epi_isl_444850_Unknown_20200403_null_1,epi_isl_430326_New_York_20200330_null_1,(epi_isl_442005_England_20200411_null_1,epi_isl_444248_England_20200418_null_3)Node751,(epi_isl_423469_England_20200331_null_1,epi_isl_440999_England_20200402_null_4)Node747,epi_isl_442516_England_20200408_null_12,epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1,epi_isl_431986_Wales_20200407_null_1,epi_isl_444184_England_20200414_null_1,epi_isl_424277_Washington_20200323_null_1,epi_isl_434630_Occitanie_20200408_null_1,epi_isl_437597_California_20200326_null_3,epi_isl_415503_Noord_Brabant_20200311_null_1,epi_isl_435429_Szeged_20200328_null_3,epi_isl_444709_New_York_20200401_null_1,epi_isl_442502_England_20200409_null_14,epi_isl_444242_England_20200418_null_1,epi_isl_442641_England_20200405_null_1,epi_isl_438883_Scotland_20200318_null_4,epi_isl_442523_Semnan_20200309_null_9,epi_isl_443294_Bretagne_20200406_null_7,epi_isl_430109_St_Petersburg_20200415_null_3,epi_isl_437793_Virginia_20200414_null_2,epi_isl_443254_Minnesota_20200402_null_1,epi_isl_435022_Texas_20200402_null_1,epi_isl_438052_Vienna_20200316_null_1,epi_isl_434697_Nonthaburi_20200303_null_2,epi_isl_434998_Texas_20200401_null_3,epi_isl_436620_Wisconsin_20200425_null_1,(epi_isl_437967_St__Anton_20200313_null_1,epi_isl_438226_Maryland_20200316_null_2,epi_isl_439545_England_20200328_null_9)Node85,epi_isl_434502_Luxembourg_20200413_null_6,epi_isl_434833_Texas_20200321_null_2,epi_isl_439807_England_20200412_null_1,epi_isl_436374_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2,epi_isl_432896_Scotland_20200406_null_1,epi_isl_436671_California_20200418_null_2,(epi_isl_420372_Vorst_20200323_null_1,epi_isl_443270_Bretagne_20200323_null_6)Node81,epi_isl_444730_New_York_20200402_null_2,epi_isl_435037_Louisiana_20200413_null_1,epi_isl_434539_Costa_Rica_20200325_null_1,epi_isl_437546_Louisiana_20200327_null_3,epi_isl_435023_Texas_20200403_null_5,epi_isl_425425_England_20200330_null_1,epi_isl_436107_New_Taipei_City_20200331_null_2,epi_isl_430514_Victoria_20200401_null_2,epi_isl_442392_England_20200408_null_2,epi_isl_443261_Bourgogne_20200403_null_2,epi_isl_433766_England_20200101_null_1,epi_isl_426072_Idaho_20200330_null_1,epi_isl_434694_Samut_Prakarn_20200122_null_2,epi_isl_443230_Singapore_20200317_null_1,epi_isl_425863_Scotland_20200319_null_1,epi_isl_435100_Uttar_Pradesh_20200329_null_1,epi_isl_423055_England_20200319_null_1,epi_isl_416374_Shanghai_20200207_null_1,epi_isl_432009_Wales_20200407_null_2,epi_isl_436732_Abruzzo_20200427_null_1,epi_isl_422505_New_York_20200319_null_1,epi_isl_432110_Wales_20200324_null_1,epi_isl_423136_England_20200323_null_1,epi_isl_416395_Shanghai_20200209_null_1,epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_1,epi_isl_423845_England_20200324_null_1,epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1,epi_isl_436076_New_York_20200309_null_3,epi_isl_427740_New_South_Wales_20200321_null_3,epi_isl_424955_New_York_20200401_null_1,epi_isl_425699_Scotland_20200312_null_1,epi_isl_428794_New_York_20200405_null_1,epi_isl_421489_Portugal_20200320_null_1,epi_isl_434619_Occitanie_20200301_null_1,(epi_isl_423011_Washington_20200319_null_3,epi_isl_444265_England_20200418_null_5)Node856,epi_isl_429530_Unknown_20200325_null_2,epi_isl_427710_New_South_Wales_20200321_null_1,epi_isl_429452_Unknown_20200310_null_1,epi_isl_444282_England_20200416_null_1,epi_isl_427721_New_South_Wales_20200319_null_2,epi_isl_433180_Scotland_20200419_null_1,epi_isl_436731_Abruzzo_20200426_null_1,epi_isl_441432_Northern_Ireland_20200317_null_1,epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1,epi_isl_434531_Louisiana_20200331_null_2,epi_isl_437747_Madinah_20200420_null_1,epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1,epi_isl_429982_Virginia_20200406_null_1,epi_isl_422741_Netherlands_20200325_null_1,epi_isl_421514_Centre__Val_de_Loire_20200320_null_1,epi_isl_428752_Connecticut_20200409_null_1,epi_isl_438625_England_20200421_null_5,epi_isl_421305_Wisconsin_20200319_null_1,epi_isl_429789_Luxembourg_20200331_null_1,epi_isl_441883_England_20200430_null_1,epi_isl_421616_New_York_20200320_null_2,epi_isl_430070_St_Petersburg_20200407_null_1,epi_isl_422573_Friesland_20200330_null_1,epi_isl_421196_Li_ge_20200330_null_1,epi_isl_427457_Wisconsin_20200413_null_3,epi_isl_435637_California_20200311_null_1,epi_isl_442387_England_20200410_null_5,epi_isl_421688_Minnesota_20200316_null_1,epi_isl_424339_Washington_20200324_null_2,epi_isl_441296_England_20200401_null_1,epi_isl_420727_England_20200328_null_1,epi_isl_433858_England_20200408_null_1,epi_isl_441884_England_20200430_null_2,epi_isl_437557_California_20200330_null_1,epi_isl_417972_Madrid_20200309_null_1,epi_isl_435059_EC_20200320_null_1,epi_isl_422860_Noord_Brabant_20200320_null_1,epi_isl_421728_New_York_20200318_null_1,epi_isl_436046_Virginia_20200401_null_1,epi_isl_425491_England_20200318_null_2,epi_isl_420191_England_20200327_null_1,epi_isl_437514_Alaska_20200323_null_8,(epi_isl_430547_Victoria_20200401_null_1,epi_isl_442736_England_20200405_null_3)Node452,epi_isl_425146_Wisconsin_20200331_null_1,epi_isl_422954_Zuid_Holland_20200327_null_3,epi_isl_441354_England_20200420_null_3,epi_isl_424663_Li_ge_20200405_null_2,epi_isl_416495_Hauts_de_France_20200310_null_1,epi_isl_427695_New_South_Wales_20200322_null_2,(epi_isl_435674_Brunei_20200311_null_1,epi_isl_437823_Washington_20200331_null_2)Node449,epi_isl_423808_England_20200323_null_1,epi_isl_416746_ARA_20200303_null_1,epi_isl_428926_Malopolskie_20200328_null_2,epi_isl_425061_Ghent_20200325_null_9,epi_isl_416994_Castilla_y_Le_n_20200304_null_1,epi_isl_444978_Catalonia_20200320_null_1,(epi_isl_436130_Victoria_20200413_null_1,epi_isl_437671_Unknown_20200329_null_2)Node446,epi_isl_437874_Athens_20200320_null_2,epi_isl_417520_Taoyuan_20200309_null_1,epi_isl_444855_Unknown_20200403_null_2,epi_isl_423399_England_20200329_null_2,epi_isl_417689_Reykjavik_20200313_null_1,epi_isl_424491_Reykjavik_20200320_null_2,(epi_isl_436392_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1,epi_isl_436808_Michigan_20200312_null_1)Node443,epi_isl_439301_Scotland_20200427_null_7,epi_isl_418309_England_20200325_null_1,epi_isl_436354_Comunitat_Valenciana_20200325_null_1,epi_isl_425279_England_20200330_null_1,epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1,epi_isl_433394_Scotland_20200407_null_7,epi_isl_430653_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_441927_England_20200411_null_1,(epi_isl_411956_Texas_20200211_null_1,epi_isl_417709_Reykjavik_20200316_null_2)Node437,epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1,epi_isl_427140_Victoria_20200406_null_1,epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_1,epi_isl_433353_Scotland_20200326_null_4,epi_isl_426530_Arizona_20200317_null_1,epi_isl_420102_Singapore_20200305_null_1,epi_isl_436081_New_York_20200317_null_1,(epi_isl_438062_Vienna_20200318_null_1,epi_isl_444681_New_York_20200330_null_2)Node431,epi_isl_426668_Victoria_20200322_null_3,epi_isl_419987_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_426927_Victoria_20200328_null_2,epi_isl_426833_Victoria_20200326_null_2,epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1,epi_isl_429782_Luxembourg_20200329_null_1,(epi_isl_413596_NSW_20200228_null_1,epi_isl_443236_Singapore_20200317_null_1)Node428,epi_isl_426817_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_419675_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1,epi_isl_439224_Scotland_20200423_null_1,epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1,epi_isl_434283_Washington_20200326_null_1,(epi_isl_420730_England_20200327_null_1,epi_isl_435133_United_Arab_Emirates_20200310_null_4)Node112,(epi_isl_422713_Netherlands_20200322_null_1,epi_isl_427129_Victoria_20200405_null_1)Node106,epi_isl_429382_Unknown_20200309_null_8,epi_isl_436421_Assam_20200331_null_1,epi_isl_422775_Netherlands_20200327_null_1,epi_isl_434606_Virginia_20200411_null_1,(epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1,epi_isl_426754_Victoria_20200327_null_2)Node425,(epi_isl_428861_Moscow_20200311_null_1,epi_isl_429229_Abruzzo_20200321_null_3)Node422,(epi_isl_421893_England_20200327_null_1,epi_isl_430859_Norrbotten_20200402_null_2,epi_isl_444198_England_20200415_null_1)Node417,(epi_isl_423494_England_20200331_null_1,epi_isl_435122_United_Arab_Emirates_20200314_null_5)Node414,epi_isl_414010_England_20200226_null_1,epi_isl_440403_England_20200314_null_1,epi_isl_437939_Strass_im_Zillertal_20200406_null_1,epi_isl_437930_Ischgl_20200309_null_1,epi_isl_436871_Michigan_20200327_null_1,epi_isl_436834_Michigan_20200322_null_1,epi_isl_436462_Madhya_Pradesh_20200416_null_1,epi_isl_436437_Delhi_20200408_null_1,epi_isl_436346_Comunitat_Valenciana_20200327_null_1,epi_isl_435698_Singapore_20200318_null_2,epi_isl_435110_Delhi_20200316_null_1,epi_isl_435109_Delhi_20200317_null_1,epi_isl_435103_Ladakh_20200317_null_3,epi_isl_432442_Wales_20200330_null_4,epi_isl_432336_Wales_20200301_null_1,epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1,epi_isl_430706_Victoria_20200413_null_1,epi_isl_430652_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1,epi_isl_430492_Victoria_20200401_null_1,epi_isl_430008_Amman_20200404_null_1,epi_isl_429182_Bangkok_20200328_null_1,epi_isl_426469_Virginia_20200330_null_1,epi_isl_425788_Scotland_20200312_null_1,epi_isl_423825_England_20200322_null_1,epi_isl_423783_England_20200324_null_1,epi_isl_423778_England_20200324_null_1,epi_isl_423569_England_20200331_null_1,epi_isl_423567_England_20200401_null_1,epi_isl_423492_England_20200331_null_1,epi_isl_423454_England_20200331_null_1,epi_isl_423387_England_20200328_null_2,epi_isl_422426_Dasman_20200316_null_1,epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_2,epi_isl_428924_Chelyabinsk_Region_20200328_null_1,epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1,epi_isl_445161_Louisiana_20200407_null_13467,epi_isl_423153_England_20200324_null_1,epi_isl_422424_Dasman_20200315_null_1,epi_isl_422255_Wales_20200323_null_1,epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1,(epi_isl_436444_Maharashtra_20200409_null_1,epi_isl_438906_Scotland_20200318_null_6)Node173,epi_isl_420718_England_20200327_null_1,epi_isl_419405_Wales_20200316_null_1,epi_isl_417242_England_20200303_null_1,epi_isl_441414_Northern_Ireland_20200318_null_1,epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1,(epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1,epi_isl_432077_Wales_20200407_null_1,epi_isl_424286_Oregon_20200320_null_1,epi_isl_444766_New_York_20200403_null_3)Node328,(epi_isl_438092_Vienna_20200323_null_1,epi_isl_442496_England_20200420_null_1,epi_isl_444065_California_20200430_null_1)Node323,(epi_isl_430537_Victoria_20200403_null_1,epi_isl_417374_Washington_20200315_null_1,epi_isl_445116_California_20200331_null_8)Node318,((epi_isl_444458_Gujarat_20200426_null_9,epi_isl_444593_Illinois_20200320_null_1)Node314,epi_isl_430474_Victoria_20200331_null_1)Node313,(epi_isl_436809_Michigan_20200313_null_1,epi_isl_435145_Abruzzo_20200324_null_5,epi_isl_444125_England_20200408_null_1)Node303,(epi_isl_420694_England_20200328_null_1,epi_isl_430191_Washington_20200316_null_1)Node300,(epi_isl_434244_Washington_20200402_null_1,epi_isl_425436_England_20200401_null_1,epi_isl_423803_England_20200324_null_6,epi_isl_423804_England_20200324_null_1)Node293,(epi_isl_418330_Ontario_20200305_null_1,epi_isl_438174_Washington_20200427_null_3,epi_isl_438597_England_20200421_null_1)Node288,(epi_isl_417365_Washington_20200314_null_1,epi_isl_438245_District_of_Columbia_20200314_null_5)Node285,(epi_isl_421707_New_York_20200318_null_1,epi_isl_433071_Scotland_20200414_null_2)Node282,epi_isl_417500_Minnesota_20200314_null_2,(epi_isl_418341_Ontario_20200312_null_1,epi_isl_444173_England_20200411_null_15)Node278,(epi_isl_430892_Washington_20200312_null_1,epi_isl_441033_England_20200406_null_44)Node275,(epi_isl_434315_Washington_20200330_null_6,epi_isl_434461_Athens_20200329_null_2)Node272,(epi_isl_429037_California_20200325_null_1,epi_isl_445174_California_20200331_null_1)Node269,(epi_isl_422947_Zuid_Holland_20200326_null_1,epi_isl_434127_Washington_20200308_null_2)Node266,(epi_isl_434270_Washington_20200325_null_1,epi_isl_444744_New_Jersey_20200402_null_3)Node263,(epi_isl_423008_Washington_20200318_null_2,epi_isl_432600_England_20200329_null_1)Node260,(epi_isl_424181_USA_20200316_null_1,epi_isl_434675_Stockholm_20200420_null_5)Node257,(epi_isl_417351_Washington_20200312_null_1,epi_isl_421743_Luxembourg_20200317_null_1)Node254,((epi_isl_418065_Washington_20200313_null_1,epi_isl_418078_Washington_20200315_null_1)Node248,(epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_10,epi_isl_424893_Virginia_20200308_null_1)Node245,epi_isl_430525_Victoria_20200402_null_1,epi_isl_430934_Washington_20200401_null_1,epi_isl_415594_Washington_20200310_null_1,epi_isl_418928_Washington_20200315_null_1,epi_isl_416702_Washington_20200313_null_1,epi_isl_426096_Washington_20200325_null_1,epi_isl_445172_California_20200325_null_1189,epi_isl_418850_British_Columbia_20200313_null_1,epi_isl_429612_Washington_20200326_null_1,epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1,epi_isl_444054_California_20200429_null_1,epi_isl_423027_Washington_20200318_null_1,epi_isl_437531_Oregon_20200417_null_1,epi_isl_424220_Washington_20200321_null_2,epi_isl_438221_Washington_20200422_null_4,epi_isl_418874_Washington_20200316_null_1,epi_isl_437857_Washington_20200405_null_1,epi_isl_444069_California_20200430_null_1,epi_isl_424849_Arizona_20200309_null_1)Node206,(epi_isl_430124_Washington_20200306_null_5,epi_isl_441037_England_20200404_null_2)Node251,(epi_isl_426878_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_444261_England_20200418_null_6)Node309,epi_isl_427800_New_South_Wales_20200324_null_3,(epi_isl_443232_Singapore_20200317_null_1,epi_isl_434541_Puerto_Rico_20200323_null_1,epi_isl_445125_Louisiana_20200401_null_4)Node336,(epi_isl_434221_Washington_20200406_null_4,epi_isl_434242_Washington_20200406_null_2)Node342,epi_isl_443292_Bretagne_20200403_null_4,epi_isl_436658_California_20200409_null_1,epi_isl_435287_Israel_20200301_null_2,((epi_isl_434557_Manila_20200327_null_1,epi_isl_423457_England_20200328_null_2,epi_isl_423461_England_20200330_null_1)Node353,epi_isl_423178_England_20200324_null_2)Node352,epi_isl_430731_Beijing_20200204_null_1,epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1,(epi_isl_432040_Wales_20200331_null_1,epi_isl_444712_New_York_20200402_null_2)Node365,epi_isl_431901_Wales_20200404_null_4,epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1,epi_isl_422332_Wales_20200326_null_1,epi_isl_423467_England_20200330_null_1,epi_isl_430148_Washington_20200323_null_1,epi_isl_435108_Delhi_20200315_null_1,epi_isl_425218_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1,epi_isl_431013_Alaska_20200317_null_1,epi_isl_427493_New_York_20200401_null_1,epi_isl_418977_New_York_20200317_null_1,epi_isl_436940_LA_20200408_null_2,epi_isl_427376_Liege_20200407_null_1,epi_isl_418390_Finland_20200313_null_1,epi_isl_433567_Scotland_20200401_null_1)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node1":"test",
"Node1007":"test",
"Node106":"test",
"Node112":"test",
"Node173":"test",
"Node206":"test",
"Node245":"test",
"Node248":"test",
"Node251":"test",
"Node254":"test",
"Node257":"test",
"Node260":"test",
"Node263":"test",
"Node266":"test",
"Node269":"test",
"Node272":"test",
"Node275":"test",
"Node278":"test",
"Node282":"test",
"Node285":"test",
"Node288":"test",
"Node293":"test",
"Node300":"test",
"Node303":"test",
"Node309":"test",
"Node313":"test",
"Node314":"test",
"Node318":"test",
"Node323":"test",
"Node328":"test",
"Node336":"test",
"Node342":"test",
"Node352":"test",
"Node353":"test",
"Node365":"test",
"Node414":"test",
"Node417":"test",
"Node422":"test",
"Node425":"test",
"Node428":"test",
"Node431":"test",
"Node437":"test",
"Node443":"test",
"Node446":"test",
"Node449":"test",
"Node452":"test",
"Node473":"test",
"Node489":"test",
"Node495":"test",
"Node498":"test",
"Node502":"test",
"Node512":"test",
"Node529":"test",
"Node532":"test",
"Node536":"test",
"Node541":"test",
"Node544":"test",
"Node548":"test",
"Node551":"test",
"Node554":"test",
"Node565":"test",
"Node575":"test",
"Node580":"test",
"Node584":"test",
"Node590":"test",
"Node594":"test",
"Node599":"test",
"Node601":"test",
"Node624":"test",
"Node636":"test",
"Node643":"test",
"Node646":"test",
"Node649":"test",
"Node650":"test",
"Node661":"test",
"Node666":"test",
"Node685":"test",
"Node707":"test",
"Node71":"test",
"Node727":"test",
"Node747":"test",
"Node751":"test",
"Node81":"test",
"Node85":"test",
"Node856":"test",
"epi_isl_406844_Victoria_20200125_null_1":"background",
"epi_isl_407084_Aichi_20200125_null_1":"background",
"epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1":"background",
"epi_isl_408484_Sichuan_20200115_null_1":"background",
"epi_isl_411956_Texas_20200211_null_1":"background",
"epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1":"background",
"epi_isl_413596_NSW_20200228_null_1":"background",
"epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1":"background",
"epi_isl_414010_England_20200226_null_1":"background",
"epi_isl_414578_Talca_20200304_null_1":"background",
"epi_isl_415503_Noord_Brabant_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_415594_Washington_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_416374_Shanghai_20200207_null_1":"background",
"epi_isl_416395_Shanghai_20200209_null_1":"background",
"epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1":"background",
"epi_isl_416495_Hauts_de_France_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_416702_Washington_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_416746_ARA_20200303_null_1":"background",
"epi_isl_416994_Castilla_y_Le_n_20200304_null_1":"background",
"epi_isl_417242_England_20200303_null_1":"background",
"epi_isl_417351_Washington_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_417365_Washington_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_417374_Washington_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_417420_NanChang_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_417500_Minnesota_20200314_null_2":"background",
"epi_isl_417520_Taoyuan_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_417689_Reykjavik_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_417709_Reykjavik_20200316_null_2":"background",
"epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2":"background",
"epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_417939_California_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_417972_Madrid_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_418065_Washington_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_418078_Washington_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_418080_Washington_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_418309_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_418330_Ontario_20200305_null_1":"background",
"epi_isl_418341_Ontario_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_418390_Finland_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_418737_England_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_418835_British_Columbia_20200311_null_2":"background",
"epi_isl_418850_British_Columbia_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_418874_Washington_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_418928_Washington_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_418977_New_York_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1":"background",
"epi_isl_419405_Wales_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_419675_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_419819_Victoria_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_419952_Victoria_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_419987_Victoria_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_419994_Victoria_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_420102_Singapore_20200305_null_1":"background",
"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1":"background",
"epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_420191_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_420287_England_20200320_null_2":"background",
"epi_isl_420355_Ronse_20200306_null_1":"background",
"epi_isl_420372_Vorst_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_420415_Montignies_Sur_Sambre_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_420694_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_420718_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_420727_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_420730_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_421189_Li_ge_20200330_null_3":"background",
"epi_isl_421196_Li_ge_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_421305_Wisconsin_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_421489_Portugal_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_421514_Centre__Val_de_Loire_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_421616_New_York_20200320_null_2":"background",
"epi_isl_421631_New_York_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_421688_Minnesota_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_421707_New_York_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_421728_New_York_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_421743_Luxembourg_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_421893_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_422255_Wales_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_422332_Wales_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_422424_Dasman_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_422426_Dasman_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_422505_New_York_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_422573_Friesland_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_422713_Netherlands_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_422741_Netherlands_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_422775_Netherlands_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_422860_Noord_Brabant_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_422925_Zuid_Holland_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_422947_Zuid_Holland_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_422954_Zuid_Holland_20200327_null_3":"background",
"epi_isl_423008_Washington_20200318_null_2":"background",
"epi_isl_423011_Washington_20200319_null_3":"background",
"epi_isl_423027_Washington_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_423055_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_423124_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423136_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423153_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423158_England_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_423178_England_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_423363_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_423387_England_20200328_null_2":"background",
"epi_isl_423399_England_20200329_null_2":"background",
"epi_isl_423454_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423457_England_20200328_null_2":"background",
"epi_isl_423461_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_423467_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_423469_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423492_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423494_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423530_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_423567_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_423569_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423579_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423778_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423783_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423803_England_20200324_null_6":"background",
"epi_isl_423804_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423808_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423825_England_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_423845_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_424181_USA_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_424220_Washington_20200321_null_2":"background",
"epi_isl_424277_Washington_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_424286_Oregon_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_424339_Washington_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_10":"background",
"epi_isl_424491_Reykjavik_20200320_null_2":"background",
"epi_isl_424663_Li_ge_20200405_null_2":"background",
"epi_isl_424849_Arizona_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_424893_Virginia_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_424947_New_York_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_424955_New_York_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_425061_Ghent_20200325_null_9":"background",
"epi_isl_425146_Wisconsin_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_425218_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_425279_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_425425_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_425436_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_425491_England_20200318_null_2":"background",
"epi_isl_425658_Scotland_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_425699_Scotland_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_425724_Scotland_20200312_null_3":"background",
"epi_isl_425788_Scotland_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_425810_Scotland_20200305_null_1":"background",
"epi_isl_425863_Scotland_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_426072_Idaho_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_426096_Washington_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_426325_New_York_20200306_null_1":"background",
"epi_isl_426469_Virginia_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_426530_Arizona_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_426668_Victoria_20200322_null_3":"background",
"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_426754_Victoria_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_426817_Victoria_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_426833_Victoria_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_426878_Victoria_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_426927_Victoria_20200328_null_2":"background",
"epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_427129_Victoria_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_427140_Victoria_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_427288_Ohio_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_427349_Liege_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_427376_Liege_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_427417_Doha_20200323_null_3":"background",
"epi_isl_427452_Wisconsin_20200410_null_2":"background",
"epi_isl_427457_Wisconsin_20200413_null_3":"background",
"epi_isl_427493_New_York_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_427610_New_York_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_427664_New_South_Wales_20200317_null_2":"background",
"epi_isl_427695_New_South_Wales_20200322_null_2":"background",
"epi_isl_427710_New_South_Wales_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_427721_New_South_Wales_20200319_null_2":"background",
"epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_427740_New_South_Wales_20200321_null_3":"background",
"epi_isl_427756_New_South_Wales_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_427765_New_South_Wales_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_427773_New_South_Wales_20200325_null_13":"background",
"epi_isl_427800_New_South_Wales_20200324_null_3":"background",
"epi_isl_428231_New_Taipei_City_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_428260_Wisconsin_20200316_null_2":"background",
"epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_428752_Connecticut_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_428761_New_York_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_428767_New_York_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_428794_New_York_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_428850_Singapore_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_428861_Moscow_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_428866_Lipetsk_Region_20200311_null_2":"background",
"epi_isl_428904_Moscow_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_428924_Chelyabinsk_Region_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_428926_Malopolskie_20200328_null_2":"background",
"epi_isl_428992_California_20200408_null_8":"background",
"epi_isl_429037_California_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_429182_Bangkok_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_429229_Abruzzo_20200321_null_3":"background",
"epi_isl_429294_Unknown_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_429336_Unknown_20200303_null_11":"background",
"epi_isl_429382_Unknown_20200309_null_8":"background",
"epi_isl_429452_Unknown_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_429463_Unknown_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_429530_Unknown_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_429565_Unknown_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_429612_Washington_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_429644_Washington_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_429782_Luxembourg_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_429789_Luxembourg_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_429982_Virginia_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_430008_Amman_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_430070_St_Petersburg_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_430109_St_Petersburg_20200415_null_3":"background",
"epi_isl_430124_Washington_20200306_null_5":"background",
"epi_isl_430148_Washington_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_430191_Washington_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_430326_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_430341_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_430414_New_York_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_430439_Malaysia_20200305_null_1":"background",
"epi_isl_430474_Victoria_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_430492_Victoria_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_430514_Victoria_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_430525_Victoria_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_430537_Victoria_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_430547_Victoria_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_2":"background",
"epi_isl_430652_Victoria_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_430653_Victoria_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_430654_Victoria_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_430706_Victoria_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1":"background",
"epi_isl_430731_Beijing_20200204_null_1":"background",
"epi_isl_430819_Egypt_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_430859_Norrbotten_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_430892_Washington_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_430934_Washington_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_431013_Alaska_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_431901_Wales_20200404_null_4":"background",
"epi_isl_431986_Wales_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_432009_Wales_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_432034_Wales_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_432040_Wales_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_432077_Wales_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_432110_Wales_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_432209_Wales_20200402_null_4":"background",
"epi_isl_432236_Wales_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_432315_Wales_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_432336_Wales_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_432393_Wales_20200402_null_13":"background",
"epi_isl_432442_Wales_20200330_null_4":"background",
"epi_isl_432600_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_432733_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_432896_Scotland_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_432990_England_20200401_null_6":"background",
"epi_isl_433071_Scotland_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_433161_Scotland_20200417_null_1":"background",
"epi_isl_433180_Scotland_20200419_null_1":"background",
"epi_isl_433353_Scotland_20200326_null_4":"background",
"epi_isl_433394_Scotland_20200407_null_7":"background",
"epi_isl_433424_Scotland_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_433507_Scotland_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_433567_Scotland_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_433677_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_433679_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_433715_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_433746_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_433766_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_433787_England_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_433793_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_433858_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_434127_Washington_20200308_null_2":"background",
"epi_isl_434221_Washington_20200406_null_4":"background",
"epi_isl_434242_Washington_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_434244_Washington_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_434270_Washington_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_434283_Washington_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_434315_Washington_20200330_null_6":"background",
"epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_434354_Ghent_20200327_null_4":"background",
"epi_isl_434461_Athens_20200329_null_2":"background",
"epi_isl_434462_Athens_20200323_null_4":"background",
"epi_isl_434502_Luxembourg_20200413_null_6":"background",
"epi_isl_434531_Louisiana_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_434539_Costa_Rica_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_434541_Puerto_Rico_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_434557_Manila_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_434606_Virginia_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_434619_Occitanie_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_434630_Occitanie_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_434675_Stockholm_20200420_null_5":"background",
"epi_isl_434694_Samut_Prakarn_20200122_null_2":"background",
"epi_isl_434697_Nonthaburi_20200303_null_2":"background",
"epi_isl_434833_Texas_20200321_null_2":"background",
"epi_isl_434998_Texas_20200401_null_3":"background",
"epi_isl_435022_Texas_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_435023_Texas_20200403_null_5":"background",
"epi_isl_435037_Louisiana_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_435047_Nur_Sultan_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_435071_Delhi_20200325_null_4":"background",
"epi_isl_435077_Maharashtra_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_435100_Uttar_Pradesh_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_435103_Ladakh_20200317_null_3":"background",
"epi_isl_435108_Delhi_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_435109_Delhi_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_435110_Delhi_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_435112_Bihar_20200328_null_3":"background",
"epi_isl_435122_United_Arab_Emirates_20200314_null_5":"background",
"epi_isl_435127_United_Arab_Emirates_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_435133_United_Arab_Emirates_20200310_null_4":"background",
"epi_isl_435145_Abruzzo_20200324_null_5":"background",
"epi_isl_435287_Israel_20200301_null_2":"background",
"epi_isl_435429_Szeged_20200328_null_3":"background",
"epi_isl_435471_Louisiana_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_435475_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_435537_New_York_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_435543_New_York_20200422_null_1":"background",
"epi_isl_435544_New_York_20200422_null_4":"background",
"epi_isl_435637_California_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_435674_Brunei_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_435698_Singapore_20200318_null_2":"background",
"epi_isl_436046_Virginia_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_436076_New_York_20200309_null_3":"background",
"epi_isl_436077_New_York_20200319_null_7":"background",
"epi_isl_436081_New_York_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_436107_New_Taipei_City_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_436123_Victoria_20200411_null_2":"background",
"epi_isl_436130_Victoria_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_436157_Karnataka_20200417_null_3":"background",
"epi_isl_436254_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_436305_Comunitat_Valenciana_20200326_null_7":"background",
"epi_isl_436346_Comunitat_Valenciana_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_436354_Comunitat_Valenciana_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_436373_Comunitat_Valenciana_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_436374_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2":"background",
"epi_isl_436392_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_436421_Assam_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_436437_Delhi_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_436444_Maharashtra_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_436462_Madhya_Pradesh_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_436620_Wisconsin_20200425_null_1":"background",
"epi_isl_436630_Wisconsin_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_436658_California_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_436671_California_20200418_null_2":"background",
"epi_isl_436717_Moscow_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_436731_Abruzzo_20200426_null_1":"background",
"epi_isl_436732_Abruzzo_20200427_null_1":"background",
"epi_isl_436808_Michigan_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_436809_Michigan_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_436834_Michigan_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_436871_Michigan_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_436940_LA_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_437140_Michigan_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_437279_Bavaria_20200401_null_7":"background",
"epi_isl_437319_Kocaeli_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_437340_Kinshasa_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_437378_Minnesota_20200413_null_3":"background",
"epi_isl_437440_Gujarat_20200426_null_1":"background",
"epi_isl_437514_Alaska_20200323_null_8":"background",
"epi_isl_437526_Oregon_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_437528_Oregon_20200419_null_1":"background",
"epi_isl_437531_Oregon_20200417_null_1":"background",
"epi_isl_437546_Louisiana_20200327_null_3":"background",
"epi_isl_437557_California_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_437571_California_20200425_null_2":"background",
"epi_isl_437597_California_20200326_null_3":"background",
"epi_isl_437626_Telengana_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_437671_Unknown_20200329_null_2":"background",
"epi_isl_437740_Madinah_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_437747_Madinah_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_437793_Virginia_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_437823_Washington_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_437857_Washington_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_437874_Athens_20200320_null_2":"background",
"epi_isl_437930_Ischgl_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_437939_Strass_im_Zillertal_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_437948_Innsbruck_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_437967_St__Anton_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_438052_Vienna_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_438062_Vienna_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_438092_Vienna_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_438174_Washington_20200427_null_3":"background",
"epi_isl_438221_Washington_20200422_null_4":"background",
"epi_isl_438225_Maryland_20200321_null_4":"background",
"epi_isl_438226_Maryland_20200316_null_2":"background",
"epi_isl_438245_District_of_Columbia_20200314_null_5":"background",
"epi_isl_438577_England_20200420_null_3":"background",
"epi_isl_438597_England_20200421_null_1":"background",
"epi_isl_438608_England_20200420_null_20":"background",
"epi_isl_438625_England_20200421_null_5":"background",
"epi_isl_438717_England_20200425_null_1":"background",
"epi_isl_438883_Scotland_20200318_null_4":"background",
"epi_isl_438906_Scotland_20200318_null_6":"background",
"epi_isl_439085_Scotland_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_439146_Scotland_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_439224_Scotland_20200423_null_1":"background",
"epi_isl_439301_Scotland_20200427_null_7":"background",
"epi_isl_439545_England_20200328_null_9":"background",
"epi_isl_439709_England_20200408_null_4":"background",
"epi_isl_439807_England_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_440303_England_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_440403_England_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_440995_England_20200402_null_3":"background",
"epi_isl_440999_England_20200402_null_4":"background",
"epi_isl_441033_England_20200406_null_44":"background",
"epi_isl_441037_England_20200404_null_2":"background",
"epi_isl_441296_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_441354_England_20200420_null_3":"background",
"epi_isl_441414_Northern_Ireland_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_441432_Northern_Ireland_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_441690_Northern_Ireland_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_441883_England_20200430_null_1":"background",
"epi_isl_441884_England_20200430_null_2":"background",
"epi_isl_441927_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_442005_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_442155_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_442387_England_20200410_null_5":"background",
"epi_isl_442392_England_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_442496_England_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_442502_England_20200409_null_14":"background",
"epi_isl_442510_England_20200326_null_46":"background",
"epi_isl_442516_England_20200408_null_12":"background",
"epi_isl_442523_Semnan_20200309_null_9":"background",
"epi_isl_442641_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442700_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442736_England_20200405_null_3":"background",
"epi_isl_443203_Singapore_20200318_null_6":"background",
"epi_isl_443230_Singapore_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_443232_Singapore_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_443236_Singapore_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_443248_Singapore_20200320_null_85":"background",
"epi_isl_443254_Minnesota_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_443261_Bourgogne_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_443270_Bretagne_20200323_null_6":"background",
"epi_isl_443292_Bretagne_20200403_null_4":"background",
"epi_isl_443294_Bretagne_20200406_null_7":"background",
"epi_isl_444054_California_20200429_null_1":"background",
"epi_isl_444057_California_20200428_null_5":"background",
"epi_isl_444065_California_20200430_null_1":"background",
"epi_isl_444069_California_20200430_null_1":"background",
"epi_isl_444125_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_444151_England_20200409_null_11":"background",
"epi_isl_444173_England_20200411_null_15":"background",
"epi_isl_444183_England_20200414_null_3":"background",
"epi_isl_444184_England_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_444198_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_444212_England_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_444220_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_444234_England_20200416_null_28":"background",
"epi_isl_444242_England_20200418_null_1":"background",
"epi_isl_444248_England_20200418_null_3":"background",
"epi_isl_444261_England_20200418_null_6":"background",
"epi_isl_444265_England_20200418_null_5":"background",
"epi_isl_444282_England_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_444320_England_20200420_null_6":"background",
"epi_isl_444328_England_20200427_null_1":"background",
"epi_isl_444342_England_20200427_null_1":"background",
"epi_isl_444348_England_20200426_null_2":"background",
"epi_isl_444427_England_20200419_null_16":"background",
"epi_isl_444434_England_20200101_null_50":"background",
"epi_isl_444439_England_20200416_null_5":"background",
"epi_isl_444451_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_444458_Gujarat_20200426_null_9":"background",
"epi_isl_444480_Gujarat_20200430_null_1":"background",
"epi_isl_444491_Stockholm_20200301_null_2":"background",
"epi_isl_444593_Illinois_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_444681_New_York_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_444699_New_York_20200330_null_4":"background",
"epi_isl_444709_New_York_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_444712_New_York_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_444720_New_York_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_444730_New_York_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_444744_New_Jersey_20200402_null_3":"background",
"epi_isl_444766_New_York_20200403_null_3":"background",
"epi_isl_444782_New_York_20200318_null_174":"background",
"epi_isl_444793_Queensland_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_444850_Unknown_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_444855_Unknown_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_444918_Unknown_20200330_null_441":"background",
"epi_isl_444942_Unknown_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_444976_Catalonia_20200406_null_9":"background",
"epi_isl_444978_Catalonia_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_445084_Texas_20200325_null_196":"background",
"epi_isl_445116_California_20200331_null_8":"background",
"epi_isl_445125_Louisiana_20200401_null_4":"background",
"epi_isl_445144_Louisiana_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_445161_Louisiana_20200407_null_13467":"background",
"epi_isl_445172_California_20200325_null_1189":"background",
"epi_isl_445174_California_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_445182_California_20200412_null_1":"background"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":43
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":10
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":54
}
}
}